Reaxys數據庫的功能提升與檢索技巧

孫 君 楊毓麗 夏立娟

（大連理工大學圖書館，遼寧 大連 116024）

孫 君 女，1971年生。碩士，館員。

Reaxys是全球三大出版集團之一愛思維爾（Elsevier）公司在2009年新推出的一款新穎實用的檢索和合成路線設計工具，目前國內十幾所高校圖書館通過CALLS組團的方式正式購買，大家已經可以享受到Reaxys數據庫給化學化工等領域的專業人士帶來的極大便利。

1 Reaxys數據庫簡介

Reaxys數據庫是Elsevier公司將原有的Crossfire Beilstein、Crossfire Gmelin以及新增的專利化學數據庫內容進行整合后的升級產品，比以前的數據庫數據量增加了20%。

1.1 CrossFire Gmelin數據庫

CrossFire Gmelin數據庫是一個數值和事實型數據庫，它將傳統的Gmelin手冊電子化，并將其內容大大豐富了，CrossFire Gmelin數據庫所覆蓋的范圍是無可比擬的，包括來源于《Gmelin Handbook of Inorganic and Organometallic Chemistry》（1772 ～1975）的數據，以及來源于1975年以后的包括材料科學期刊中的數據，是無機和金屬有機化學領域收錄數據最廣泛的數據庫，是高質量無機和金屬有機化學數據的同義詞。

1.2 CrossFire Beilstein數據庫

CrossFire Beilstein數據庫是世界上最大的有機化學事實數據庫，數據來源為1779年至1959年《Beilstein Handbook》、《Beilstein有機化學大全》從正編到第四補編的全部內容和1960年以來的原始文獻（各種國際性的科學雜志以及專利文獻、某些重要的學位論文和會議報告等）中述及的所有有機化合物的性質及其制備方法。CrossFire Beilstein數據庫以電子方式提供包含可供檢索的化學結構和化學反應、相關的化學和物理性質，以及詳細的藥理學和生態學數據在內的最全面的信息資源，最早的數據可追溯到1771年。

1.3 專利化學數據庫

Reaxys中新增加的專利化學數據庫（Patent Chemistry database），是來自世界知識產權組織（1978年至今）、歐洲專利局（1978年至今）以及美國專利局（1976年至今）的英文專利信息。新增的這部分內容，可以使科學家們獲得完整的反應操作步驟、Markush結構以及專利的用途等。

Reaxys對原始文獻中的數據，根據其重要性和相關性進行篩選和整合，提供化學結構、化學反應、相關的化學和物理性質以及詳細的藥理學信息，使科學家們能夠更快更準確地得到相關數據。

2 Reaxys新功能

與前代的CrossFire數據庫相比，Reaxys數據庫新增了如下功能：

①網絡訪問模式：Reaxys服務平臺改變了原有CrossFire的客戶端訪問模式，提供了基于網絡訪問的工作流模式。用戶只需在網絡瀏覽器輸入www.reaxys.com就可以直接進入數據庫，Reaxys基于IP進行訪問，用戶只要在有效IP范圍內，均可以快速登錄系統。另外，與Crossfire Commander相比，Reaxys數據庫的界面也更直觀、更人性化，使用界面更符合大眾使用習慣，更容易入手。

②從名字生成化學結構（generate structure from name）功能：對于一個復雜結構的化學物質來說，通過畫圖工具來畫出它的化學結構不是一件輕松的事，有了這個工具，用戶就可以通過已知的化學商品名、化學名（Chemical Name）、化學物質登記號（CAS-No）、簡化分子線性輸入規范（Smiles）和IUPAC國際化工標識符（InChI-Key）等途徑快速獲得它的結構式，極大地節省了用戶的畫圖時間。而且化學結構圖在反應檢索和物質檢索界面可以自由轉換，只需單擊“Copy to reactions（substances）tab”就可以實現二者的輕松轉換。

③檢索結果自動排列功能：Reaxys將檢索式和每一次的檢索結果以方框的形式自動按檢索順序排列在每個檢索結果界面的上方，通過點擊需要的方框回到上一個查詢結果，可以再次進行其他條件的篩選，從而獲得多角度、多方面的檢索結果。

④合成路線的智能設計：Reaxys為用戶提供了方便快捷的化學反應路線圖，用戶通過點擊合成（synthesize）和添加（add）按鈕就可以輕松獲得從原材料到產物的多部反應路線圖，而且每一個反應中間體都可以同時獲得多種反應途徑，這是其他數據庫所無法比擬的。

⑤二次篩選功能：Rreaxys提供了便利的二次檢索功能，當用戶對第一次檢索結果不滿意時，通過右邊的限定條件可以方便地對檢索結果進行限定，展開的二次檢索欄目，已經自動分類，并通過多次多角度的檢索獲得滿意的檢索結果。而且Rreaxys系統增加了排除功能，對不需要的檢索條目，需要從檢索結果中去除，利用此功能可以方便地把一些不需要的檢索結果去除掉，多步驟的二次檢索功能避免了一次檢索時因檢索條件太嚴格漏掉有用信息，二次篩選功能是快速、高效檢索文獻的利器。

⑥便捷的更新提醒功能：Reaxys提供了更加方便的個性化提醒功能，無論是檢索結果界面還是檢索歷史界面，在每個檢索式的下面都提供了一個創立提醒功能按鈕，用戶只需填寫簡單的信息就可以輕松獲得每次更新的信息。

⑦檢索結果的排序功能：Reaxys對檢索結果提供了多角度的排序功能，以反應檢索為例，系統提供了Reaxys RXID、產物實用性、反應物實用性、Reaxys分級、出版年、參考文獻數、產物的分子量和產量等途徑的排序方式，其他條件相近的情況下，用戶通常希望得到高的產率，用戶只需讓所有反應按產率排列，高產率的反應就會排在前面，幫助用戶更快捷地獲得需要的反應信息。

此外，系統還提供了檢索條件的本地保存功能、批處理功能以及檢索歷史的在線保存功能等，當用戶再次對相同問題進行檢索時，利用上面的功能就可免去重復提交檢索條件的麻煩。

3 檢索方法和技巧

Reaxys數據庫有3種基本檢索方式：文獻檢索（Text、authors and more）、反應檢索（Reactions）和物質與性能檢索（Substances and Properties）。下面就以具體實例詳細介紹Reaxys數據庫的3種基本檢索方法。

3.1 文獻檢索（Text、authors and more）

文獻檢索是一種與SCI或EI等其他數據庫比較相似的文獻檢索方法，包括基本格式（Form-based）和高級檢索（Advanced）?；緳z索提供了快速檢索（Quick Search）功能，指的是對一或兩個關鍵詞的檢索，以及對作者/專利權人（Author/Assignee）、刊名（Journal Title）、專利號（Patent Number）、專利國（Patent Country）和出版年（Publication Year）等途徑的檢索。高級檢索（Advance）是類似于CrossFire中的事實檢索（Fact Search）的檢索方式，需要編寫檢索式，不過檢索式的編寫非常方便，檢索框下面提供了詳細的檢索領域，對需要的檢索域代碼（field code）進行雙擊，然后填寫域值（field value），當輸入的詞不確定時，還可以使用截詞符，用“*”代替任意多個字符，系統支持左截斷或者右截斷，然后選擇不同域代碼間的邏輯關系，邏輯關系（operate）包括“near”、“and”、“next”、“not”、“or”以及“proximity”等6種布爾組配。

實例1：查找文章標題中有“P-type Semiconductors”的文獻

首先點擊文獻檢索中的高級檢索，在檢索語法（Check Syntax）框中輸入“title”，點擊“Search for field”顯示如下信息：Bibliographic Data：Citation：Journal Title（CIT.JT）Journal Title（Short）（CIT.JTS）Abstract：Title（AB.TI），引文下的題名是指刊物名稱，文摘中的題名才是我們需要的文章題名，單擊Abstract下的Title，然后單擊省略號選框并輸入“p”，選擇p（30227）并單擊轉換（Transfer）按鈕，用同樣的方法輸入type和Semiconductors，只是在邏輯關系的選擇時P與type之間用“next”，表示這兩個詞是緊挨著并是有順序的，在輸入“Semiconductors”時會發現詞尾有許多變化的形式，為了避免漏檢，我們通常采用截詞形式的檢索式：AB.TI=‘p’next AB.TI=‘type’ANDAB.ti=‘semiconduct*’，然后單擊“Search”按鈕，即得到93條文章題目中有“P-type Semiconductors”的文獻。

3.2 反應檢索（Reactions）

反應檢索實際上相當于一個反應式檢索（Reactions）和條件檢索（Conditions）組合的聯合檢索，當然也可以單獨使用反應式檢索或條件檢索，通過聯合檢索可以更加準確地得到所需要的反應。

實例2：查找產量為80%以上的阿司匹林合成反應

雙擊反應檢索框，使用畫圖工具畫出阿司匹林的結構式，單擊轉換（Transfer）按鈕返回檢索界面，或者在已知阿司匹林化學名、化學物質登記號、簡化分子線性輸入規范或IUPAC國際化工標志符的情況下，點擊由名字生成結構按鈕（Generate structure from name），把上述任何一種標識符輸入檢索框，點擊提交（Submit）按鈕，就可以快速生成結構圖，結構圖的右側提供了對所畫結構的限制條件，可以設定為產物、反應物、任何一個、試劑/催化劑在本題中選擇產物，然后，選定所畫結構或子結構，為了檢索的精確性，選擇精確結構檢索，然后單擊條件（Conditions（form-based））按鈕，在產量（Yield）一欄的運算關系中選擇大于號，產量一欄填上80，然后點擊檢索按鈕，便可以得到7個產量在80%以上的阿司匹林的合成反應。

3.3 物質與性能檢索（Substances and Properties）

物質與性能檢索與反應檢索方式相似，是一個物質結構檢索（Substances）和性能檢索（Properties）組合的聯合檢索，并可單獨進行檢索，通過聯合檢索可以更加精確地得到你所需要的物質。

實例3：查找具有生物活性的吉非替尼（Gefitinib）

首先通過畫圖工具畫出吉非替尼的結構，或者通過由名字生成結構工具自動生成結構，然后限定物質結構為精確結構檢索，由于本例只要求吉非替尼具有生物活性，而不要求具體的生物活性數值，本例中需要通過性能的高級檢索來實現。首先單擊性能的高級檢索（Properties（Advanced））按鈕，接著單擊性能列表中“Bioactivity/Ecotox”旁的“exists”鏈接，然后點擊檢索按鈕，就可以得到33個具有生物活性的吉非替尼。

4 檢索結果的顯示與輸出

4.1 檢索結果的顯示

檢索完成后，Reaxys數據庫會自動切換到檢索結果的界面，以物質檢索為例，系統默認以表格形式（Table）顯示，表格從左到右依次為：序號、化學物質結構、化學名、制備該物質的數量、可獲得的數值領域、參考文獻數和沸點。具有超鏈接功能的用紅色顯示，用戶只需單擊感興趣的鏈接就可以獲得需要的反應或數值信息，物質也可以以網格（Grid）的形式顯示，這與Crossfire的網格顯示方式相似。

4.2 檢索結果的輸出

Reaxys能夠靈活地對檢索結果進行各種處理，幫助用戶以各種方式將檢索內容自動生成圖表和報告，并以Word、Excel或XML等多種格式進行存儲。用戶只需在所需條目左邊的空白框中做標記，然后點擊輸出（Output）按鈕，選擇需要的輸出格式并保存。當然還可以對輸出范圍進行限定，可以是全部的也可以是部分內容或選定的內容，輸出內容包括：物質結構、可獲得數值、僅僅是物質識別信息、僅僅是命中信息以及選擇信息。通常我們不對所有可獲得數值進行輸出，因為要輸出的內容太多，會大大降低數據的輸出效率。

綜上所述，與CrossFire比較，Reaxys數據庫在功能上更加強大，不僅數據涵蓋面非常廣，而且配有強大的搜索引擎，為用戶提供了更加方便、快捷、人性化和高效的檢索途徑，并且檢索結果的保存、輸出與瀏覽功能更加簡潔、直觀、省時易用，同時對檢索結果提供了多角度的二次篩選功能，是化學化工研究者必不可少的網上檢索工具。

[1]Reaxys Web Set：www.reaxys.com.

[2]CrossFire Gmelin/Beilstein數據庫.