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29種毒力基因在91株食源性單核細胞增生李斯特氏菌中的分布

2017-12-13 07:39,,,,,
中國人獸共患病學報 2017年11期
關鍵詞:食源性血清型李斯特

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·論著·

29種毒力基因在91株食源性單核細胞增生李斯特氏菌中的分布

李秀娟,趙冬,潘琢,高偉利,徐保紅,秦麗云

目的了解河北省食源性單核細胞增生李斯特菌(Listeriamonocytogenes,Lm)毒力基因分布特征。方法采用普通PCR方法對Lm的29個毒力基因(包括毒力島Ⅰ在內的6個位點:prfA、plcA、plcB、hlyA、mpl和actA;內化素家族的10個位點:inlA、inlB、inlC、inlD、inlE、inlF、inlG、inlH/C2、inlI和inlJ;其他13個毒力相關位點:bsh、srtA、iap、sigB、virR、mprF、dltA、dltB、dltC、dltD、srtB、fbpA和hpt)進行檢測。結果在91株Lm中,有23個毒力基因的檢出率為100%。26株Lm的29種毒力基因全部檢出,65株Lm存在inlD、inlF、inlG、inlH/C2、inlJ和mpl等6個毒力基因的不同缺失。缺失最嚴重的為inlG和inlF,缺失率分別為60.44%和54.95%;其次為mpl基因,缺失率為19.78%。根據毒力基因缺失情況,91株菌可分為10個基因型,優勢毒力基因型為具有全部23種毒力基因的Ⅰ型。石家莊地區的毒力菌株缺失率(41/52)高于河北北部地區(11/22)。結論河北省食源性Lm的毒力基因攜帶率高,毒力基因缺失具有多樣性且存在地域差異。

單核細胞增生李斯特菌;毒力基因;分布特征

單核細胞增生李斯特氏菌(Listeriamonocytogenes,Lm)是一種重要的食源性人獸共患病原菌,是一種兼性胞內寄生菌,可引起人和多種動物的胃腸炎、腦膜炎、敗血癥、流產等,新生兒、孕婦、老年人和免疫功能低下者更易感染發病。Lm可穿越宿主的3個屏障系統進入機體,引起侵襲性感染,而該侵襲性由多種毒力基因和酶有關,目前研究的毒力基因主要有與黏附和侵襲有關的因子、與胞內感染有關的因子,以及毒力調控因子和應答調控因子等。研究報道顯示,Lm的毒力基因攜帶率較高,但也有不同程度的基因缺失現象,缺失情況各有不同[1-3]。為了能夠進一步了解該菌毒力基因的分布特點,本研究對分離自河北省的91株食源性Lm進行了29個毒力基因的檢測,為該菌致病性的評估和研究提供進一步參考。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1菌株 本研究檢測的91株食源性Lm,均于2005-2011年間(無2009年)分離自來源于河北省不同地區的生禽肉、生畜肉、水食產品、速凍米面制品及涼拌菜。其中52株Lm分離株由石家莊市疾病預防控制中心檢出,其余39株Lm由河北省疾病預防控制中心饋贈。所有Lm菌株均經API Listeria 鑒定試劑條進行鑒定、確認, 并經多重PCR血清型分型[4], 其中 1/2a型(1/2a和3a) 41株、1/2b 型(1/2b、3b和7)30株、1/2c型(1/2c和3c)7株、4b 型(4b、4d和4e)13株。

1.1.2試劑 GoTaq○RColorless Master Mix(美國Promega公司,批號:00000390447);PCR 引物(大連TAKARA公司合成)。

1.1.3儀器9700型PCR儀(美國ABI公司);Qiaxcel 毛細管電泳儀(德國 Qiagen 公司)。

1.2 方法

1.2.1毒力基因擴增引物 參考文獻[5-14],篩選出29個毒力基因,包括毒力島Ⅰ(IPL-1)在內的6個位點prfA、plcA、plcB、hlyA、mpl和actA;毒力島Ⅱ(IPL-2)即內化素家族的10個位點inlA、inlB、inlC、inlD、inlE、inlF、inlG、inlH/C2、inlI和inlJ;其他與毒力相關的13個毒力位點:bsh、srtA、iap、sigB、virR、mprF、dltA、dltB、dltC、dltD、srtB、fbpA和hpt。引物設計采用Primer5.0軟件,根據NCBI上已經公布的序列,選擇保守性較高的區域作為引物設計區域(表1)。

表1 29種毒力基因檢測用PCR引物
Tab.1 Primers of 29 virulence genes of Lm

毒力基因Virulencegene引物方向(5′?3′)Directionofprimers產物大小Productsize(bp)參考來源ReferenceprfAF?ACCAATGGGATCCACAAGA467[5]R?CAGCTGAGCTATGTGCGATplcAF?CTCGGACCATTGTAGTCATCTT326[6]R?CACTTTCAGGCGTATTAGAAACGAplcBF?GATAACCCGACAAATACTGACGTAAATAC503[7]R?TCATCTGAGCAAAATCTTTTTGCTACCATGTChlyAF?GCAGTTGCAAGCGCTTGGAGTGAA456[8]R?GCAACGTATCCTCCAGAGTGATCGbshF?GTTGTTCCACCGAGCCTAAA526[9]R?GGAAATGCGGATTACAAGGAsrtAF?TCTATCGCAGTTCCATCTGT400[9]R?TCTCTAGTTCTTTTGTTAGCTTTTCiapF?TTTGCTAAAGCGGGTATCTC205[10]R?AGCCGTGGATGTTATCGTATsigBF?CCAAGAAAATGGCGATCAAGAC165[11]R?CGTTGCATCATATCTTCTAATAGCTmplF?CGCTAAGTTCTGGTGGTT207本研究R?TTCCGACATAACTTTTCACAvirRF?GCTACAAGACTTCACCAATC210[15]R?GTGGAGTAAACCTTTTTGAACmprFF?GTTTCGCCTTCAAGCGTGTC222[15]R?GATACAAGCAACGGTTCCCTA表1(續)毒力基因Virulencegene引物方向(5′?3′)Directionofprimers產物大小Productsize(bp)參考來源ReferencedltAF?AGAGTCTCCTGTGCGATA277[12]R?ATACGGACCTACAGAAGCdltBF?ACCAGAAAGAAAGCGTCAT712本研究R?AGTCCAGTCCAAGGAGCdltCF?GAAGGCTTGCTTGATTCTATG113[12]R?TCAGGAGTAGCCCATTCGTCdltDF?TCCATTGATAGGCGGGTTA287[12]R?AAGATCGCGTAAGCAAAGGsrtBF?CATTCGTATTCCGATAA269本研究R?AAATAAGCATAACCAGACfbpAF?GCTGAACAAGGCTATCT171本研究R?CCAGTATTCATTATTCCTAhptF?CCGTTTATTGTATTCAAGC331本研究R?GTTCCAGTTAAGCCATTinlAF?CAACGTTTGATAATGACGGTGT458[9]R?ATTTGTAGTCGGCGGAGTGTinlBF?AATCACTTTCTTTGGAGCATAATGGTATAAGTG562[7]R?GTTCCATCAACATCATAACTTACTGTGTAAACCinlCF?CCATCTGGGTCTTTGACAGTA398[9]

R?CAAATAAGTGACCTTAGTCCTTinlDF?CTTGTGGTCCCTAATAACAT449本研究R?GAACGTATAGCCATCCTTCGinlEF?GGCCTTTCTGGTGAGCTT402本研究R?TGGTTCTTCGTTCTCAGTGinlFF?TGACTTATTTGCAGTTGGGGT1119[9]R?TTGGTTCAGGAATAAGCGCGinlGF?GTGAAGACGGAACTTGGAAA668[13]R?GCTTCTACTATCGGTTGAACAinlH/C2F?ATAGCTACTTTATCAGCATTT437[13]R?ATATCACTTATTTTATTATCATCinlIF?GTTTCCAGACGACAATCTTGCTA635[13]R?AATCGGTACAGTTACTCGCATCAinlJF?AAATCCAGCCCCTGAAAAAG545[9]R?CGCCTGTTTTTGGTAGGGTAactAF?TAGCGTATCACGAGGAGG539[14]R?TTTTGAATTTCATATCATTCACC

1.2.2DNA模板制備 從血平板上挑取過夜培養的Lm新鮮菌落至400 μL 1×TE(pH8.0)緩沖液中,震蕩混勻,煮沸5 min后冰上冷卻,10 000 r/min離心5 min,取上清于-20 ℃保存備用。

1.2.3毒力基因檢測 29個位點均采用單重PCR檢測,PCR體系為:2×Gotaq○RColorless Master Mix 12.5 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各1 μL,DNA模板1 μL,加水補足體積至25 μL。PCR參數為:95 ℃ 4 min;94 ℃ 30 s,52 ℃ 30 s,72 ℃ 40 s,35個循環;72 ℃ 7 min。采用QIAxcel DNA Screening Kit卡夾經全自動毛細管電泳儀檢測PCR產物。

1.2.4PCR產物測序確認 29個毒力基因的部分陽性擴增產物送大連寶生物公司進行雙向測序,并對測序結果進行序列比對,確認擴增產物為目的基因。

1.2.5統計分析 利用Bionumerics Version 7.6軟件,采用Categorical UPGMA方法進行缺失毒力基因聚類分析,采用SPSS 21.0軟件對不同地區分離的菌株毒力基因缺失差異情況進行χ2檢驗,以Plt;0.05為差異有統計學意義。

2 結 果

2.1毒力基因檢測結果 在91株Lm中,有23個毒力基因的檢出率均為100%。其中26株Lm的29種毒力基因全部檢出,65株Lm分別存在inlD、inlF、inlG、inlH/C2、inlJ和mpl等6個毒力基因的不同缺失。49株Lm菌株出現2種及2種以上毒力基因的缺失。

表2 91株Lm毒力基因檢測結果
Tab.2 Results of 29 virulence genes in 91 foodborne Lm

毒力基因Virulencegenes陽性菌株數(株)No.ofpositivestrains檢出率(%)DetectionratesinlD8492.31inlG3639.56inlF4145.05inlH/C28997.80inlJ8492.31mpl7380.22prfA、plcA、plcB、hlyA、actA、inlA、inlB、inlC、inlE、inlI、bsh、srtA、iap、sigB、virR、mprF、dltA、dltB、dltC、dltD、srtB、fbpA、hpt91100.00

2.2毒力基因分型分析 根據不同毒力基因缺失情況進行聚類分析(圖1),91株Lm可分為10個毒力基因型別,其中型別最多的Ⅰ型,由具有全部29個毒力基因的26株菌株組成,占28.57%,其次為同時缺失InlF和InlG毒力基因的Ⅵ型(23株)以及不僅缺失InlF和InlG毒力基因,還缺失mpl毒力基因的Ⅸ型(17株),分別占25.27%和18.68%。

圖1 缺失毒力基因聚類分析圖Fig.1 Clustering analysis of deletion virulence genes

2.3毒力基因缺失與分子血清型關系 29種毒力基因全部檢出的26株菌株均為1/2a血清型。在出現缺失的6個毒力基因中,inlD缺失菌株全部為1/2c型(7/7);inlJ缺失菌株全部為4b型(7/13);mpl缺失菌株全部為1/2b型(18/30)。1/2a型菌株主要缺失inG和/inlF基因;1/2b型菌株主要為inG、inlF和mpl基因的缺失;1/2c型菌株主要缺失inlD;4b型菌株主要為inlF、inlG和inlJ3種毒力基因的缺失。在10個毒力基因型中,除了Ⅵ型中包含有1/2a、1/2b和4b血清型外,其余各型均只有1種血清型(圖1、表3)。

2.465株毒力基因缺失菌株分離地區分析 為方便計算,本研究將65株毒力基因缺失菌株按地區來源不同分為3大地區,其中石家莊地區41株,河北南部地區(邯鄲、衡水、滄州)13株,河北北部地區(保定、承德、廊坊、秦皇島、唐山、張家口)11株,不同地區分離菌株毒力基因缺失差異有統計差異(χ2=6.125,P=0.043),石家莊地區分離的Lm菌株毒力基因缺失率(78.85%)高于河北北部地區(50%)(χ2=6.158,P=0.013)。河北北部地區和石家莊地區的主要分離株為1/2b型, 河北南部地區主要分離株為4b型。在河北北部和河北南部地區Lm分離株中,毒力基因型主要為Ⅶ(8)型,分別占8株和5株,主要缺失毒力基因為inlF和inlG。石家莊地區由于菌株最多,表現出更多的毒力基因型,主要毒力基因型為Ⅷ(14)、Ⅵ(12)、Ⅱ(6)和Ⅲ(5)型,缺失主要毒力基因inlF、inlG和mpl(表4)。

表3 65株毒力基因缺失菌株血清型
Tab.3 Serotype of 65 Lm strains with virulence genes deletion

缺失毒力基因Deletionvirulencegenes菌株數(株)No.ofstrains分子血清型(菌株數)Serotype(No.ofstrains)inlD71/2c(7)inlF501/2a(9);1/2b(28);4b(13)inlG551/2a(14);1/2b(30);4b(11)inlH/C224b(1);1/2a(1)inlJ74b(7)mpl181/2b(18)

表4 不同地區分離Lm菌株的分子血清型與毒力基因型別分布
Tab.4 Regional distribution of serotype and subtype of virulence genes in 91 Lm strains

地區District菌株總數No.ofstrains毒力基因缺失菌株數No.ofstrainswithvirulencegenesdeletion缺失毒力基因菌株分子血清類型Serotypeofstrainswithvirulencegenedeletion1/2a1/2b4b1/2c河北北部NorthernHebei2211Ⅵ(2)Ⅵ(6)Ⅷ(2)lt;FounderNodename=""value=""/gt;Ⅲ(1)河北南部SouthernHebei1713Ⅱ(1)Ⅵ(1)Ⅸ(1)Ⅷ(2)Ⅵ(1)Ⅶ(5)Ⅹ(1)Ⅲ(1)石家莊Shijiazhuang5241Ⅱ(5)Ⅴ(1)Ⅵ(5)Ⅱ(1)Ⅵ(4)Ⅷ(14)Ⅳ(2)Ⅵ(3)Ⅶ(1)Ⅲ(5)合計Total9165Ⅱ(6)Ⅴ(1)Ⅵ(8)Ⅱ(1)Ⅸ(1)Ⅵ(10)Ⅷ(18)Ⅳ(2)Ⅵ(4)Ⅶ(6)Ⅹ(1)Ⅲ(7)

3 討 論

Lm一般經胃腸道感染,侵入腸上皮細胞后被單核巨噬細胞吞噬,并隨其擴散到局部淋巴結,最后到達內臟器官,引起全身性感染。整個感染過程由一系列的步驟組成,包括內化、逃離吞噬泡、Lm在宿主細胞內的極向運動與細胞間傳播,需要許多毒力蛋白因子和酶參與其中。Lm的致病性與其毒力基因密切相關,缺失毒力基因將導致其致病性的消失或下降。通過檢測毒力基因,可掌握這些基因在Lm中的分布,從而為評估Lm分離株的致病性強弱,進行相關監測提供實驗室支持。

本研究對91株河北省食源性Lm進行了29個毒力基因的檢測,包括毒力島Ⅰ(Listeriamonocytogenespathogenicity islands,LIPI-1)在內的6個基因、內化素家族的10個基因位點inlA、inlB、inlC、inlD、inlE、inlF、inlG、inlH/C2、inlI和inlJ,以及其他目前研究較多的13個毒力相關位點:bsh、srtA、iap、sigB、virR、mprF、dltA、dltB、dltC、dltD、srtB、fbpA和hpt。研究結果顯示河北省食源性Lm具有很高的毒力基因攜帶率,29個毒力基因中有23個位點檢出率為100%,僅6個毒力基因出現不同程度的缺失,具有較高的潛在致病性,該結果與目前報道一致[1,3,10,16],因此我國應加強食品中該病菌的監測,臨床治療中應增強對李斯特菌病的重視和培訓,從而更好的發現和防控李斯特菌病。

在91株Lm中,有65株Lm有1-4種毒力基因的缺失,毒力基因缺失菌株比例較高,總缺失率為71.43%。根據缺失毒力基因的聚類分析,91株菌株分為10個毒力基因型,具有較高的多態性。除毒力基因Ⅵ型含有1/2a、1/2b和4b血清型以外,其余9個型別都僅有一種血清型,提示了毒力基因型別與血清型具有較高的相關性,其內在關系還需進一步研究。我國食品中Lm分離株主要為1/2a血清型[17],而引起食源性疾病最多的血清型也是1/2a血清型[18],本次檢測結果也顯示63.4%的1/2a菌株具有全部29個毒力基因,菌株的致病力較強,較易引發食源性疾病。

LIPL-1毒力島與Lm的致病性密切相關,是細菌在細胞內的生存必不可少的,具有高度保守性[19]。本次檢測的91株Lm中,IPL-1中的6個毒力基因,除了mpl基因以外,均具有較高的穩定性。mpl基因編碼鋅依賴金屬蛋白酶(Zinc metalloprotease),參與Lm在細胞間的直接傳遞,可避免自身被體液免疫系統清除,此外,該酶還介導毒力因子卵磷脂磷脂酶C(PC-PLC)(由plcB基因編碼)的前體在吞噬體中的活性,是LIPL-1中的一個重要的毒力因子。本次研究顯示在60%的1/2b血清類型菌株(18/30)中出現缺失或變異,提示在該血清類型菌株具有較大的毒力缺陷,致病性較弱。

內化素是Lm毒力相關基因編碼的一個蛋白質家族,介導細菌侵入無吞噬能力的上皮細胞,其N端都含有富含亮氨酸的串聯重復區域,該區域被認為與蛋白質-蛋白質相互作用及多種功能相關,參與黏附、配體-受體相互作用以及信號傳導等過程。InlA、InlB以及InlC是研究較多的內化素蛋白,分別在黏附、侵襲以及胞內生存和擴散方面具有重要作用[20-23]。內化素基因容易發生堿基突變,具有多態性,還容易發生水平基因轉移和重組[24]。本研究檢測的10個內化素家族成員中有5個基因發生了變異和缺失,inlG和inlF2個基因的缺失率均高于50%,inlD、inlH/C2和inlJ等3個基因也發生了不同程度的缺失。本研究還發現,除了1/2a血清型外,其余3種血清類型,每一種血清類型均出現了一種特定內化素基因的缺失,如所有1/2b血清型菌株均缺失inlG基因,所有4b菌株均缺失inlF基因,所有1/2c菌株均缺失inlD基因;另外還有一些基因的缺失僅出現在某一種特定血清型的菌株中,如inlD缺失僅見于1/2c型菌株;inlJ基因缺失也是只在部分4b型菌株中出現。這兩種不同形式的內化素基因缺失狀況,顯示出內化素基因的缺失與血清型具有一定的相關性,可能是該血清型中一些菌株的毒力基因發生了變異,還需要進一步研究。

在本研究檢測的13種毒力相關基因中,bsh和sigB與細菌耐受環境的壓力應答有關,srtB與逃避巨噬細胞吞噬有關,srtA、fbpA與細菌的侵襲、粘附相關,iap、mprF與抵抗宿主防御有關,hpt與細胞內增值有關,dltA、dltB、dltC、dltD與細胞感染相關,virR具有調控功能,是一種應答調控因子,調控包括mprF、dltA、dltB等在內的12 個毒力基因。這13種毒力基因是細菌耐受環境壓力、細胞內生存、逃逸以及細胞感染有關的基礎基因,具有一定的保守型。本研究結果也顯示該13種毒力相關基因在91株菌株中均存在,進一步證明該13種基因在Lm菌株中的高度保守性,其缺失將可能會明顯影響菌株的生存。

本研究通過對91株食源性Lm中29個毒力基因的檢測,證明了一些毒力基因對于Lm生存感染是必須的,具有高度的保守性;另有一些毒力基因如內化素家族成員基因和mpl基因則具有一定的多態性,容易發生變異和缺失。曾有文獻報道hlyA、inlA和plcB3個毒力基因的檢出情況與Lm的MLST分型聚類有較一致的關系,可為分析Lm毒力強弱提供參考意義[25],本研究發現毒力基因缺失菌株具有一定的地域差異,毒力基因缺失變異與菌株的血清類型也具有一定聯系,因此進一步研究毒力基因缺失變異的地域特點以及與血清類型的關系對于制定防控策略以及分析Lm的毒力強弱同樣具有重要的參考意義。

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Distributioncharacterizationof29virulencegenesin91foodborneListeriamonocytogenesstrains

LI Xiu-juan, ZHAO Dong, PAN Zhuo, GAO Wei-li, XU Bao-hong, QIN Li-yun

(DepartmentofMicrobiology,ShijiazhuangCenterforDiseaseControlandPrevention,Shijiazhuang050011,China)

In order to study the distribution of virulence genes ofListeriamonocytogenes(Lm) in Hebei Province, 29 virulence genes ofLm, includingListeriamonocytogenespathogenicity islands Ⅰ(LIPI-Ⅰ:prfA,plcA,plcB,hlyA,mplandactA), 10 internalins genes (inlA,inlB,inlC,inlD,inlE,inlF,inlG,inlH/C2,inlIandinlJ) and the other 13 virulence-associated genes (bsh,srtA,iap,sigB,virR,mprF,dltA,dltB,dltC,dltD,srtB,fbpAandhpt) were detected by PCR. Results showed that in the 91 Lm strains, the detection rate of 23 virulence genes were 100%. The 29 virulence genes of 26 Lm strains were all detected, and 65Lmstrains had different deletion of 6 virulence genesinlD,inlF,inlG,inlH/C2,inlJandmpl. The deletion rate ofinlGandinlFwere 60.44% and 54.95%, respectively, following by mpl gene, with a deletion rate of 19.78%. According to the absence of virulence genes, 91 strains could be divided into 10 subtypes, and the dominant virulence subtypes was type Ⅰwith all 23 virulence genes.The deletion rate of virulent genes in Shijiazhuang was higher than that in northern Hebei. It is suggested that the rate of virulence gene of food-borneLmin Hebei Province is high, and the virulence gene deletion patterns has diversity and regional differences.

Listeriamonocytogenes; virulence genes; distribution characteristics

10.3969/j.issn.1002-2694.2017.11.005

河北省醫學科學研究重點課題(No. ZL20140244)

石家莊市疾病預防控制中心,石家莊 050011

Email:wsws1120@126.com

R378.99

A

1002-2694(2017)11-0972-07

Supported by the Hebei Medical Scientific Research Fund Project(No. ZL20140244)

2017-02-20編輯張智芳

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