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基于網絡藥理學探討藏紅花抗動脈粥樣硬化的作用機制

2021-07-03 08:13張菀桐
海南醫學院學報 2021年12期
關鍵詞:藏紅花靶點通路

楊 靜,任 星,張菀桐,高 蕊

(1.北京中醫藥大學研究生院,北京100029;2.中國中醫科學院西苑醫院,北京100091)

動脈粥樣硬化(atherosclerosis,AS)是一種常見的重要血管疾病,通常從受累動脈內膜開始,先后出現多種病變,包括脂質和復合糖類的局部積聚、纖維組織增生、鈣質沉積形成斑塊和動脈中膜的退變[1]。目前心腦血管疾病對人類的生命健康已構成了嚴重的威脅[2,3],AS 作為心腦血管疾患的重要危險因素,發病率逐年增高,且呈現一定的年輕化趨勢,嚴重危及人類健康。因此,有效防治AS 成為了預防心腦血管疾病發生的關鍵[4]。目前抗AS 的治療主要通過他汀類降脂藥物進行干預,但其長期用藥的安全性備受爭議。劉昌孝[5]在對他汀類藥物的安全性風險評價中發現該類藥物具有肝損害、增加癌癥風險以及造成骨骼肌損害等不良反應。中醫認為痰濁、瘀血、毒邪(熱毒)阻滯損傷脈絡,日久脈絡瘀阻,是AS 發生的病機[6],中醫中藥治療AS 具有獨特優勢及特色,多通過化痰泄濁、活血化瘀、清熱解毒等進行治療[7]。

藏紅花,又名“西紅花”、“番紅花”,為鳶尾科植物番紅花的干燥柱頭,性味甘、微寒,歸心、肝經,功能活血化瘀,涼血解毒,解郁安神,適用于經閉癥瘕,產后瘀阻,溫毒發斑,憂郁痞悶,驚悸發狂[8]。目前已有較多研究報告了藏紅花對心腦血管疾病的治療,認為藏紅花酸可能是其作用的物質基礎[9]。有學者利用藏紅花酸干預AS 大鼠模型發現其可以下調大鼠主動脈LOX-1 的表達,對AS 具有一定的療效。Asdaq 等[11]給予血脂異常大鼠藏紅花提取液,與對照組進行比較,藏紅花可顯著調節大鼠脂代謝紊亂從而到達抗AS 效果。以上研究表明,藏紅花具有一定的抗AS 作用,但其具體作用成分和機制尚未完全明確。

網絡藥理學作為藥理學的分支學科,運用網絡方法分析藥物與疾病及其靶點間的“多成分、多靶點、多途徑”的協同作用關系,各中藥在不同方劑中的配伍及加減運用亦體現了其多成分、多靶點、多途徑的特性,兩者特點相一致[12]。因此,本研究基于網絡藥理學的方法分析藏紅花抗AS 的活性成分及其作用機制,以指導臨床用藥并為下一步的藥理研究提供基礎。

1 材料與方法

1.1 獲取藏紅花藥物候選靶點

登錄中藥系統藥理學數據庫和分析平臺(TC‐MSP Databases),搜索并獲取藏紅花的藥物化學成分,根據類藥性≥0.18 進一步篩選藏紅花的有效化合物。根據藥物已知成分,在TCMSP Databasess 及Genecards Databases 獲取成分作用靶點,將獲取的靶點進行去重處理,排除重復靶點。運用Uniprot 數據庫査詢靶點蛋白對應的基因簡稱,得到藏紅花調控的疾病靶點。構建候選藥物成分-候選靶點網絡圖(candidate compound-candidate target network,cCcT network)

1.2 獲取AS 靶點

登錄DisGeNET 數據庫獲取疾病藥物作用靶點,以atherosclerosis(動脈粥樣硬化)為關鍵詞,人類基因為背景,提取數據庫中信度較高(score>0.001)的相關基因靶點,進行去重、統一名稱等處理,獲取疾病相關基因。 將所獲取的基因導入Cyto‐scape3.7.2 軟件中構建分子網絡,并進行可視化加工和拓撲結構分析,得到疾病-靶點網絡(Disease-po‐tential target network,D-pT network)。

1.3 藏紅花成分-AS 靶點網絡構建

通過映射cC-cT network 于D-pT network,得到藏紅花藥物成分治療AS 的靶點,應用Cyto‐scape3.7.2 軟件構建藥物-候選成分-AS 的候選靶點網 絡(Herb-potential compound-potential target net‐work,H-pC-pT network)。

1.4 GO 生物進程及KEGG 通路分析

將cC-cT network 與D-pT network 的映射基因導入Cytoscape3.7.2 軟件的ClueGO 插件中進行GO生物進程及KEGG 通路富集分析。

2 結果

2.1 藏紅花藥物化學成分篩選

利用TCMSP 數據庫,以藏紅花、西紅花、番紅花為檢索詞,以類藥性≥0.18 為條件篩選得到20 個化合物,并參考相關文獻加入2 個藏紅花常用活性成分[13,14],共 得 到22 個 藏 紅 花 的 有 效 活 性 成 分。見表1。

表1 藏紅花活性成分基本信息Tab 1 Basic information of active components in saffron

2.2 藏紅花藥物候選靶點篩選

將上述獲得的22 個藏紅花活性成分引入TC‐MSP 數據庫及Genecards 數據庫,獲得16 個活性成分對應113 個疾病靶點(其中有6 個活性成分的疾病靶點未被TCMSP 數據庫及Genecards 數據庫收錄)。將上述獲得的藏紅花作用靶點輸入到Uniprot數據庫中査詢靶點蛋白對應的基因簡稱,剔除非人源靶點后最終得到藏紅花調控的疾病靶點106 個。構建候選藥物成分-候選靶點網絡。見圖1。該網絡共包含123 個節點,271 條邊。其中16 個節點代表藏紅花活性成分,106 個節點代表活性成分作用的疾病靶點,255 條邊代表成分與靶點之間的作用關系。越靠近中心的靶點在網絡中度越高,說明藏紅花中有多種藥物成分作用于該靶點。

圖1 藏紅花成分-靶點網絡圖Fig 1 Target network of saffron composition

2.3 AS 候選靶點篩選

應用DisGeNET 數據庫,以atherosclerosis 為關鍵詞檢索,獲得數據庫中信度較高(score>0.001)的相關基因靶點共117 個。利用Cytoscape3.7.2 軟件進行可視化加工和拓撲結構分析,構建疾病-靶點網絡,該網絡包含118 個節點,2 151 條邊,越靠近內層說明該靶點與疾病的相關度越高。見圖2。

圖2 疾病-靶點網絡圖Fig 2 Disease-target network

2.4 藏紅花成分-AS 靶點網絡構建

將藏紅花藥物候選靶點網絡(cC-cT network)映射于AS 靶點網絡(D-pT network),結果提示,藏紅花作用于26 個疾病靶點。見表2。應用Cyto‐scape3.7.2 軟件構建藥物-候選成分-AS 的候選靶點網絡(H-pC-pT network)。該網絡包含39 個節點,101 條邊。其中11 個節點代表藏紅花活性成分,26個節點代表藏紅花作用于AS 的靶點(基因簡稱)。在網絡中,一個節點的度表示網絡中和節點相連路線的條數。在化合物方面,有3 個化合物的度值≥6,分別是藏紅花酸(crocetin),異鼠李素(isorhamne‐tin),槲皮素(quercetin)。提示在藏紅花治療AS 的過程中,藏紅花酸、異鼠李素、槲皮素3 種化學成分可能起主要作用。在化合物作用的疾病靶點方面,有4個靶點的相關度值較高,分別是內皮型一氧化氮合酶(NOS3),凝血酶(F2),過氧化物酶體增殖物激活受體γ(PPARG),前列腺素G/H 合酶2(PTGS2)。說明在藏紅花治療AS 的過程中,作用的主要靶點是內皮型-氧化氮合酶,凝血酶,過氧化物酶體增殖物激活受體γ 及前列腺素G/H 合酶2。這體現了藏紅花多成分與多靶點之間共同作用的機制。見圖3。

表2 中藥藏紅花活性成分抗動脈粥樣硬化的靶點Tab 2 Targets of saffron active components against athero?sclerosis

圖3 藥物-候選成分-動脈粥樣硬化的候選靶點網絡Fig 3 Drug-candidate component-atherosclerosis candidate target network

2.5 藏紅花與AS 相互關系的GO 生物進程分析及KEGG 通路研究

將藏紅花作用于AS 的26 個基因靶點導入Cy‐toscape3.7.2 軟件的ClueGO 插件中進行GO 及KEGG 通路富集分析,得到藏紅花治療AS 相互關系的GO 生物進程及KEGG 通路結果。

2.5.1 生物進程聚類分析結果 通過GO 生物進程分析,獲得12 個藏紅花治療AS 生物進程。見圖4。圖中面積越大,表示聚類至此生物功能的映射靶點越多,可得知藏紅花治療AS 可能主要是通過參與影響以下體內生物進程:(1)活性氧代謝過程的正調控;(2)調節平滑肌細胞增殖;(3)活性氧生物合成過程;(4)膠質細胞增殖的正調控;(5)趨化因子的生物合成過程等。

圖4 藏紅花抗AS GO 生物進程聚類分析結果Fig 4 Cluster analysis results of saffron anti-AS and GO biological process

2.5.2 KEGG 聚類分析結果 為進一步探究藏紅花抗AS 的具體機制,開展KEGG 通路探索,共獲得23 個信號通路,將其中與AS 相關的通路作為研究候選通路,包括:(1)VEGF 信號通路;(2)糖尿病并發癥中的AGE-RAGE 信號通路;(3)流體剪切應力與動脈粥樣硬化通路;(4)NF-kappaB 信號通路。見圖5。

圖5 藏紅花抗AS KEGG 通路Fig 5 KEGG pathway of saffron in the treatment of atherosclerosis

2.5.3 基于網絡藥理學初步探索藏紅花抗AS 的作用機制 結合上文藏紅花與AS 相互關系的GO 生物進程及KEGG 通路結果??傻弥丶t花抗AS 的相關通路包括VEGF 信號通路、糖尿病并發癥中的AGE-RAGE 信號通路、流體剪切應力與動脈粥樣硬化通路和NF-kappaB 信號通路。通過查詢上述通路在KEGG 數據庫中的相關作用并結合既往文獻,初步建立藏紅花抗AS 的相關通路示意圖。見圖6。

圖6 藏紅花抗AS 相關通路示意圖Fig 6 Pathway of saffron in treatment of atherosclerosis

3 討論

本研究運用網絡藥理學方法,通過分析藏紅花與AS 分子網絡在生物功能方面的異同,初步探索藏紅花抗AS 的作用機制。GO 生物進程聚類分析和KEGG 通路聚類分析表明藏紅花抗AS 可能主要通過參與活性氧代謝過程的正調控、調節平滑肌細胞增殖、活性氧生物合成過程、膠質細胞增殖的正調控、趨化因子的生物合成過程等生物進程。在信號通路的調控方面,藏紅花抗AS 可能主要調控VEGF信號通路、糖尿病并發癥中的AGE-RAGE 信號通路、流體剪切應力與動脈粥樣硬化通路和NF-kap‐paB 信號通路。晚期糖基化終產物(AGEs)是由蛋白質、脂質和核酸的非酶促糖基化和氧化產生的一組復雜的化合物[15]。RAGE 作為AGE 的模式識別受體,屬于免疫球蛋白超家族細胞表面分子的多配體受體,與積極參與炎癥和免疫反應的配體相結合[16]。

AGE/RAGE 信號傳導引起涉及NADPH 氧化酶、蛋白激酶C 和MAPKs 的多個細胞內信號途徑的激活,從而導致NF-κB 活化[1-19]。NF-κB 能促進促炎性細胞因子(如IL-1、IL-6 和TNF-α)以及與AS 相關的 基 因 血 管 內 皮 生 長 因 子(VEGF)的 表 達[20]。VEGF 能特異性地促進血管內皮細胞有絲分裂的生長因子,刺激內皮細胞合成氧化氮并上調氧化氮合酶的表達,促進新生血管形成[21]。新生血管管壁不完整,通透性強,可為斑塊局部提供養分,進一步促進AS 的發展[22]。剪切應力代表了血流施加在血管壁內皮表面的摩擦力,它在血管生物學中起著核心作用,并有助于AS 的發展[23]。低剪切應力通常會上調內皮細胞(EC)基因和蛋白,從而促進動脈壁的氧化和炎癥狀態,導致AS[24]。反映這種ECs 紊亂狀態的重要轉錄事件包括激活蛋白1 和核因子kappaB 的激活[25]?;衔?疾病靶點網絡分析顯示,藏紅花治療AS 的主要有效成分為藏紅花酸、異鼠李素、山奈酚和槲皮素。有研究表明藏紅花酸是一種天然的類胡蘿卜素二羧酸,在體內和體外模型中都有促血管生成的作用,可以通過調節VEGF 信號通路促進血管內皮細胞血管生成[26]。藏紅花酸還能增加HO-1/NRF-2 的表達,降低核因子-κB(NF-κB)mRNA 和蛋白的表達,從而抑制AS 形成[27]。異鼠李素是從中草藥沙棘中提取的黃酮類化合物,具有抗氧化和抗炎的作用[28]。一項動物實驗表明,異鼠李素能夠抑制小鼠體內TNF-α、IL-6 的產生,發揮抗炎作用[29]。槲皮素是一種中草藥中提取的黃酮類化合物。已有研究證實了它的抗炎、抗癌、抗氧化和抗凋亡活性[30]。槲皮素通過ROS 調節的PI3K/AKT 信號通路抑制炎癥和凋亡,從而減輕高果糖喂養誘導的動脈粥樣硬化。槲皮素通過減少活性氧的產生、抑制細胞凋亡和炎癥反應,從而抑制高果糖所致的動脈粥樣硬化[30]。

由此,筆者推測,藏紅花抗AS 可能主要通過藏紅花酸、異鼠李素及槲皮素等有效化學成分發揮抗炎及抑制血管新生的作用。

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