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現代農業土壤屬性空間預測方法綜述

2023-05-09 14:04梁瑞琳
農業研究與應用 2023年6期
關鍵詞:土壤養分機器學習土壤

摘要:土壤是陸地生態系統中的核心,具有多種屬性,主要包括土壤質地、土壤鹽度、土壤養分、土壤有機碳(Soil organic carbon,SOC)、土壤酸堿度、土壤含水率等,在動植物生長、調節氣候變化以及保護生物多樣性等方面發揮著關鍵作用。近些年來土壤問題變得日益嚴峻,量化土壤的各種屬性變得至關重要。通過分析總結土壤屬性空間預測的多元/逐步線性回歸、偏最小二乘回歸等線性回歸方法,支持向量機、隨機森林和人工神經網絡等機器學習方法,以及多層感知器和卷積神經網絡等深度學習方法,可以為提升土壤屬性的空間預測精度,緩解土壤問題,促進生態環境的可持續發展提供理論支撐。因此,在對區域土壤屬性進行空間預測時,應充分考慮各種條件的影響,將多種空間預測方法相結合,以此提升土壤屬性的預測精度,促進土壤生態系統的健康發展。

關鍵詞:土壤;空間預測;土壤有機質;土壤養分;機器學習

中圖分類號:S159 文獻標志碼:A

A Review of Spatial Prediction Methods of Soil Properties in Modern Agriculture

LIANG Ruilin

(College of Architectural Engineering and Spatial Information, Shandong University of Technology,

Zibo, Shandong 255000, China)

Abstract: Soil is the core of terrestrial ecosystems, and it has a variety of properties, including soil texture, soil salinity, soil nutrients, soil organic carbon (SOC), soil pH, soil moisture content and so on. It plays a key role in animal and plant growth, regulating climate change and protecting biodiversity. In recent years, due to the worsening problem in soil, quantifying soil properties has become crucial. By analyzing and summarizing linear regression methods such as multivariate/stepwise linear regression and partial least squares regression for spatial prediction of soil properties, machine learning methods such as support vector machine, random forest and artificial neural network and deep learning methods such as multilayer perceptron and convolutional neural network, thus providing theoretical support for improving the spatial prediction accuracy of soil properties, alleviating soil problems and promoting the sustainable development of ecological environment. Therefore, when conducting spatial prediction of regional soil properties, the influence of various conditions should be considered and a variety of spatial prediction methods should be combined, so as to improve the prediction accuracy of soil properties and promote the healthy development of soil ecosystems.

Keywords: Soil; spatial prediction; soil organic matter; soil nutrient; machine learning

土壤是陸地生態系統中的核心,在動植物生長、調節氣候變化以及保護生物多樣性等方面發揮著重要的作用。土壤具有多種物理化學性質,主要包括土壤質地、土壤鹽度、土壤養分、土壤有機碳、土壤酸堿度、土壤含水率等。土壤有機碳(Soil organic carbon,SOC)是反映土壤的結構和功能、土壤肥力以及支持動植物健康生活的關鍵指標[1],在穩定生態系統和促進陸地碳循環中起著關鍵作用,土壤碳(C)、氮(N)等養分,通過影響凋零物的分解、營養物質的循環積累和土壤微生物運動[2],來影響土壤肥力和生產力,是決定植物營養水平的關鍵因素之一[3],土壤微生物可以促進植物養分的轉化和循環,土壤鹽度對土壤養分循環、有機質分解、植物生產力和生物多樣性有顯著影響[4]。近年來,由于城市化和工業化的高速發展,導致可耕種土地大量減少[5],由于施肥不足或不平衡,導致土壤肥力逐漸下降[6],土壤問題變得日益嚴峻,因此對土壤的各種屬性進行測定變得至關重要。傳統的土壤屬性測定主要通過室外土壤樣品采集和室內實驗室分析來實現[7],這種測量方法需要耗費大量時間,成本較昂貴,效率低下[2],難以快速得到土壤屬性的預測結果,并且使用實驗室分析試劑還可能會釋放環境污染物分子[8],不利于生態環境的可持續發展。根據現有理論和實證研究[9],有學者發現土壤屬性空間預測可以快速高效的對土壤的各種屬性進行評估,并且具有經濟、無損和成本效益高的優點[2],及時診斷土壤養分、土壤有機碳等土壤屬性的含量也是提高農業集約化和彌合產量差距的關鍵,在維持土壤功能和提供相關生態系統服務方面有著至關重要的作用[10]。因此,綜述土壤屬性空間預測研究,不僅可以為人類農業活動提供有價值的數據和理論指導[9],還在現代農業工程中具有重要的研究意義與應用價值[7]。

1 方法總述

目前土壤屬性空間預測用到的方法有很多,主要包括線性回歸(Linear regression,LR)、機器學習(Machine learning,ML)和深度學習(Deep learning,DL)三種類型。在土壤屬性的空間預測過程中,各種模型的應用過程多種多樣。部分研究采用單一預測模型對土壤屬性進行空間預測,如BANGROO等利用回歸克里格法(Regression-kriging,RK)分析預測變量在北克什米爾森林喜馬拉雅地區土壤有機碳和總氮空間定量中的應用[11];也有部分研究將預測模型與環境協變量等其他因素相結合對土壤屬性進行空間預測,如LELAGO等將中紅外光譜(Mid-infrared spectroscopy,MIR)與偏最小二乘回歸方法(Partial least squares regression,PLSR)相結合對埃塞俄比亞選定地區的農業土壤養分進行預測[8];還有部分研究將多種預測模型相結合,采用綜合方法對土壤屬性進行空間預測,PACINI等[12]在估算歐洲農田表層土壤有機碳含量的研究中,將土壤氣候的自然參照(Natural references per pedoclimate)、數據驅動互惠建模(Data-driven reciprocal modeling)與碳景觀區概念(The concept of carbon landscape zones)三種方法采用集成建??蚣芟嘟Y合,提出一種新的集成建模方法(Ensemble modeling),對歐洲農田表層的土壤有機碳進行空間預測??梢钥闯?,土壤屬性的空間預測方法多種多樣,因此,本文對這幾種預測模型在土壤屬性空間預測中的具體應用展開了相應的介紹。

2 線性回歸模型在農業土壤屬性空間預測中的應用

回歸模型是對連續型變量進行預測的一種機器學習模型,主要包括線性回歸(Linear regression,LR)、多項式回歸(Polynomial regression)、集成學習(Ensemble learning)、嶺回歸(Ridge regression)、Lasso回歸(Lasso regression)等模型。在土壤屬性的空間預測研究中,LR是最常用的回歸方法,其基本原理是利用數理統計中的回歸分析確定兩種或兩種以上的變量間相互依賴的定量關系。LR主要包括偏最小二乘(Partial least squares regression,PLSR)、多元線性回歸(Multiple linear regression,MLR)、逐步線性回歸(Stepwise linear regression,SWLR)、分位數回歸(Quantile regression,QR)和廣義加性模型(Generalized additive model,GAM)等,均廣泛應用于土壤屬性的評估與空間預測[5]。例如在之前的研究中,GUO等[13]采用LR模型檢驗自然土壤背景值校正的城市表層土壤微量元素濃度與總體沉積之間的相關性,用于評估大氣微量元素沉積對城市土壤污染的潛在影響。LOMBARDO等[14]采用QR模型對SOC進行空間預測,并探究了在半干旱農業區不同SOC儲量下預測因子的作用。SIRSAT等[5]利用廣泛的回歸方法對土壤養分進行空間預測,自動預測了印度幾種具有不同養分的鄉村土壤的肥力,決定在農業生產中施用適量的肥料來改善土壤肥力,并制定了相應的肥料分配和消費政策。

2.1 多元/逐步線性回歸

MLR是含有多個變量的線性回歸模型,SWLR是可以自動從大量可供選擇的變量中逐個選取所需變量的線性回歸模型,二者均在土壤屬性的評估與空間預測中發揮著重要作用。例如在之前的研究中,VA??T等[15]基于可見光-近紅外漫反射光譜(Visible to near infrared-diffuse reflectance spectrum,VNIR-DRS),利用MLR模型,通過連續去除光譜技術預測土壤中可提取的營養物質。WANG等[16]采用MLR模型,建立了預測土壤有機碳歸一化吸附系數(Soil organic carbon normalized absorption coefficients,KOC)的定量構效關系(Quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,對SOC進行空間預測。有時還將MLR與SWLR相結合,形成逐步多元線性回歸模型(Stepwise multiple linear regression,SMLR),對土壤的各種屬性進行評估與空間預測。例如WANG等應用SMLR和主成分回歸(Principal component regression,PCR)算法建立了不同變換方法預處理后的反射光譜數據與重金屬之間的關系,采用反射光譜技術對山東省典型污灌區土壤中的重金屬含量進行估算[17]。

2.2 偏最小二乘回歸

PLSR是一種多對多的線性回歸方法,適用于變量個數很多且都存在多重相關性,而樣本量又較少的情形。它可以通過從因變量和自變量的協方差矩陣中生成潛變量來去除數據集中的共線性[18],因此該模型可以使用共線且不獨立的預測變量[14]。并且它還可以同時實現多元線性回歸、主成分分析以及兩組變量之間的相關分析,因此廣泛應用于土壤屬性的評估與空間預測。例如在之前的研究中,LI等[19]采用PLSR模型,研究土壤性質、集料穩定性和集料尺寸組成、可視化植被格局和植被恢復時間對C-N-P含量和化學計量學的影響。CAMBOU等[20]利用原位獲取的可見光-近紅外反射光譜(Visible to near infrared spectrum,Vis-NIRS)和篩干樣品,比較了局部PLSR與全局PLSR模型在預測區域土壤有機碳儲量方面的性能,得出基于光譜近鄰的局部PLSR優于全局PLSR,并證明了使用建立在存檔土壤樣本上的Vis-NIRS庫可以準確地量化SOC儲量。DAS等[21]采用PLSR模型,基于Vis-NIRS對SOC進行空間預測,并得出將Vis-NIRS與PLSR相結合可以準確預測SOC含量。LELAGO等[8]將MIR光譜與PLSR模型相結合,對埃塞俄比亞選定地區的農業土壤養分進行空間預測;然而,光譜波長和客觀變量之間不僅存在線性關系,還存在非線性關系[22],因此PLSR在預測非線性變量的SOC時存在一定局限性。

2.3 多種線性回歸方法組合應用

在土壤屬性的空間預測中,除了以上兩種線性回歸模型,還有部分研究采用多種回歸模型進行空間預測。例如NOWKANDEH等[23]在估算伊朗半干旱地區的土壤有機質(Soil organic matter,SOM)含量研究中,利用Hyperion影像,采用逐步回歸(Stepwise regression,SWR)、最小回歸(Minimum regression,MinR)、PLSR和PCR模型預測伊朗半干旱地區SOM的空間分布,得出SWR和PLSR在預測整個半干旱地區土壤有機質中的精度較高。通過以上案例可以得出,LR模型具有建模速度快、可釋性好以及預測精度較高的優點。然而,該模型無法較好的擬合非線性數據,容易出現過擬合問題,因此在對土壤屬性進行空間預測時應綜合考慮多種預測方法。

3 機器學習模型在農業土壤屬性空間預測中的應用

ML指通過輸入大量訓練數據對模型進行訓練,使模型掌握數據所蘊含的潛在規律,進而對新輸入的數據進行準確分類或預測的一種方法。ML模型有很多,主要包括支持向量機(Support vector machine,SVM)、隨機森林(Random forest,RF)、人工神經網絡(Artificial neutral network,ANN)等,均廣泛用于土壤屬性的評估與空間預測,且應用形式多樣。例如CHEN等[24]在繪制農田土壤有機質的動態圖譜研究中,比較了決策樹(Decision tree,DT)、裝袋決策樹(Bagging decision tree,BDT)、RF和梯度提升回歸樹(Gradient boosting regression trees,GBRT)四種機器學習算法對中國湖北省2000年至2017年18年間農田SOM的空間預測性能,并繪制了每年500 m×500 m像素的農田土壤有機質圖,得出GBRT對SOM含量的預測效果最好。下面將分別介紹幾種常用的機器學習模型在具體土壤屬性空間預測案例中的應用。

3.1 支持向量機

SVM是一類按監督學習(Supervised learning)方式對數據進行二元分類的廣義線性分類器(Generalized linear classifier)。該模型的基本原理是求解學習樣本幾何間隔最大的分離超平面,以正確劃分訓練數據集。SVM是一種小樣本學習法,不僅算法簡單,還具有較好的“魯棒”性,因此在土壤屬性的空間預測中得到了廣泛的應用。例如GAO等[25]采用SVM校正土壤團聚體結合態有機碳(Soil aggregate-associated organic carbon,SAOC)的預測模型,對SAOC進行多元預測,為大尺度預測SOC提供了可能。ABDOLI等[26]在利用遙感數據預測伊朗部分農業土壤中SOC研究中,采用ANN、支持向量機回歸(Support vector regression,SVR)和基因表達式編程(Gene expression programming,GEP)等機器學習模型對SOC含量進行估算,得出SVR模型的預測精度更高,并得出將不同衛星的遙感數據相結合可以提高SOC的預測精度。DEVIANTI等利用Vis-NIR光譜,結合SVR、偏最小二乘-人工神經網絡(Partial least squares-artificial neural network,PLS-ANN)和梯度增強樹回歸(Gradient boosting regression trees,GBRT)三種機器學習方法預測印度尼西亞亞齊省的農田土壤養分,并比較了三種機器學習算法的性能[3]。QI等[2]利用高光譜可見-近紅外光譜(Hyperspectral visible and near-infrared)數據,并結合PLSR、LS-SVM和反向傳播神經網絡(Back propagation neural network,BPNN) 3種回歸方法,建立土壤NPK預測模型,對土壤中的NPK進行建模和預測,為利用高光譜可見-近紅外光譜數據選擇校準方法和提高對土壤NPK的預測能力提供了一個框架。盡管SVM有眾多優點,但是該模型對缺失的數據較為敏感,并且在解決非線性問題時沒有通用的解決方法,因此在對SOC進行評估與空間預測時還應綜合考慮多種預測方法。

3.2 隨機森林

RF是一種由多個決策樹相結合而成的集成機器學習模型。集成學習(Ensemble-learning)通過訓練多個學習器并將它們結合起來共同解決一個問題,因此該方法的準確率高,在土壤屬性空間預測中具有較高的預測精度。例如在之前的研究中,LIU等[27]基于可見-近紅外高光譜成像(Visible to near infrared hyperspectral imaging,Vis-NIR-HSI),利用RF模型對土壤中的有機碳進行預測,得出成像光譜技術在預測未擾動土壤輪廓中的SOC中發揮著重要作用。多數研究通常將RF模型與其他模型進行對比,以探究模型在土壤屬性空間預測中的預測精度。例如WANG等[28]利用收集的澳大利亞東部半干旱地區的數據,對比評估了增強回歸樹(Boosted regression trees,BRT)和RF模型在預測SOC儲量中的效果,并得出RF模型具有較高的預測精度。OPPONG SARKODIE等[29]分別采用Cubist模型和RF模型預測捷克共和國41個天然林區地表有機層、礦質表土層和底土層碳儲量的空間分布,并結合網格搜索超調提高預測精度,得出RF模型在地表有機層、礦質表土層和底土層森林土壤SOC儲量預測中的精度均高于Cubist模型,并且與RF模型相比,Cubist模型在預測時需要使用更多的協變量。PAUL S等在利用遙感數據對SOC和黏粒(Clay,CL)進行制圖的研究中,將來自多個陸地衛星圖像、地形指數和土壤調查信息的野外數據、土壤和土壤指數相結合,利用RF和廣義增強回歸模型(Generalized enhanced regression model,GBM)對三角洲農田SOC和CL進行數字制圖,預測土壤的工作性能,得出RF在各方面的預測精度均高于GBM[30]。還有部分研究將RF模型與其他模型相結合來提升土壤屬性的空間預測精度。例如CHINILIN等[31]在結合機器學習和環境協變量繪制俄羅斯土壤中有機碳圖的研究中,使用RF和空間交叉驗證技術(Spatial cross-validation techniques)相結合的三維建模方法,預測俄羅斯土壤中SOC含量的橫向和縱向分布,證明了將遙感數據與地形和氣候變量相結合有利于對土壤有機碳空間變異的估算,并得出土壤剖面深度和季節性溫度是最關鍵的預測因子。從以上案例中可以看出,RF模型具有較高的預測精度,且不易出現過擬合問題,因此被許多研究者所采用。然而,該方法也存在一定的局限性,即在處理取值劃分較多的特征時擬合效果較差。

3.3 人工神經網絡

ANN也是一種常用的機器學習模型,它基于多層感知器(Multilayer perceptron,MLP),采用反向傳播算法(Back-propagation algorithm,BP)計算網絡中權值所需的梯度。該模型由輸入層、隱藏層和輸出層三層組成,采用并行分布處理(Parallel distributed processing)方法,具有較高的精度,有利于對土壤屬性進行評估與空間預測。例如KIM等[6]利用ANN模型估算土壤侵蝕和養分濃度,得出在提高作物產量的同時應盡量減少環境污染問題的結論。PELLEGRINI等[32]采用ANN模型對葡萄園土壤中的微生物生物量進行預測,得出ANN模型比LR模型具有更好的擬合度,即ANN模型具有較高的預測性能。WERE等[33]將ANN與模糊邏輯相結合,設計了一種新的基于進化遺傳優化的自適應神經模糊推理系統ANFIS-EC,對毛烏素森林保護區東部土壤的SOC儲量進行空間預測,并繪制了SOC分布圖。PUDE?KO等[34]在比較傅里葉紅外光譜(Fourier transform-near infrared,FT-NIR)和近紅外高光譜成像(Near-infrared hyperspectral imaging,NIR-HSI)對礦山土壤中有機碳濃度(Concentrations of organic carbon,Corg )和總氮(Total nitrogen,Nt)含量的預測性能的研究中,采用ANN方法建立了126個樣本的預測模型,得出基于NIR-HSI的模型對Corg含量預測的準確性明顯高于基于FT-NIR數據的模型。通過以上案例可以看出,ANN模型具有較高的預測精度,但該模型也存在所有神經網絡模型所共有的缺點,即在使用過程中需要大量數據,進行大量訓練,導致訓練時間長,并且模型的計算過程較為復雜,運算量大。

4 深度學習模型在農業土壤屬性空間預測中的應用

DL是一種能學習極其復雜模式的多層神經網絡,主要用于對大規模的數據進行處理和預測,具有學習能力極強、適應性強以及可移植性好的優點,在土壤屬性的空間預測中發揮著重要的作用。常用的DL模型主要有MLP、卷積神經網絡(Convolutional neural network,CNN)、循環神經網絡(Recurrent neural network,RNN)、深度信念網絡(Deep belief networks,DBN)、長短期記憶網絡(Long short-term memory neural networks,LSTM)、門控循環單元(Gate recurrent unit,GRU)等,均廣泛應用于土壤屬性的評估與空間預測。例如WANG等采用一維卷積神經網絡(One dimensional-convolutional neural network,1D-CNN)、二維卷積神經網絡(Two dimensional-convolutional neural network,2D-CNN)、DBN、RNN、LSTM、GRU 6種DL方法,對中國南疆的SOC進行空間預測,并得出LSTM模型表現最好,DBN模型表現最差,1D-CNN、2D-CNN、RNN和DBN算法對不同的樣本量比較敏感[35]。下面將具體對土壤屬性空間預測中常用的幾種DL模型進行介紹。

4.1 多層感知器

MLP是最簡單、最經典的神經網絡。它由輸入層、隱含層和輸出層三層結構組成,并且不同層之間全連接,具有較高的準確性和較強的表達能力,因此可以用其對土壤屬性進行評估與空間預測。例如JANG等[36]在評估人類活動對澳大利亞納莫伊山谷下游土壤有機碳變化的影響研究中,采用MLP模型,以10 cm為間隔,預測土壤表層至1 m深度的SOC含量,并得出,灌溉種植區SOC損失量最大,其次為非灌溉種植區和牧草地,并且所有種植區的SOC儲量均表現出至少5 tC·ha-1的下降,表層SOC損失量最大,且隨深度增加呈指數性遞減。然而,MLP在預測時需要較多參數,并且訓練難度較大,因此在土壤屬性的空間預測的過程中,可以綜合考慮MLP與其他深度學習模型。

4.2 卷積神經網絡

CNN是目前公認的主流深度學習模型之一,成功應用于圖像處理、土壤空間預測和其他地理要素預測中[37]。CNN模型一般由輸入層、卷積層、激活層、池化層、光柵化層、全連接層和輸出層組成。其中,光柵化層有時可以省略,卷積層、激活層和池化層是CNN的核心結構,三者可以疊加重復使用。CNN模型在土壤屬性的空間預測中應用非常廣泛。例如NG等[38]采用CNN模型,使用可見/近紅外、中紅外以及它們的組合光譜同時對土壤屬性進行空間預測,得出CNN模型具有較高的預測精度。CHEN等[39]基于實驗室Vis-NIR光譜數據,采用CNN模型,對土壤濕度進行空間預測,得出CNN模型的預測精度較高,并得出基于知識的遷移學習方法是一種高效的土壤屬性空間預測方法。HOSSEINPOUR-ZARNAQ等[40]在利用Vis-NIR光譜數據預測土壤屬性的研究中,使用吸光度光譜數據開發了1D-CNN模型,對土壤屬性進行空間預測,并證明使用CNN模型和Vis-NIR光譜數據可以快速準確的評估土壤屬性。YANG等[41]在利用衛星物候變量預測區域尺度上的土壤有機碳含量研究中,利用CNN模型,將植被物候變量與自然地理變量相結合,研究空間鄰域大小對土壤預測的影響,并得出CNN模型在預測SOC含量中具有較高的精度,陸面物候指標是有效的SOC預測因子。通過以上案例可以看出,CNN模型具有較高的預測精度和效率,但同時也存在一些不足,比如由于需要處理大量數據導致該模型的訓練速度較慢,并且有時易出現過擬合問題,導致其在訓練數據上表現良好而在測試數據中的表現較差。

5 結論與討論

通過以上綜述,我們可以得出土壤屬性的空間預測方法多種多樣,且各有優缺點。通過對土壤屬性進行空間預測,可以探究土壤各種屬性對土壤肥力以及植物生長的影響,治理土壤污染,解決當下日益嚴峻的土壤問題,并且可以提升土壤肥力,增加作物的產量,對實行精準農業,土地退化監測,土地利用管理,保護生態環境以及實現我國雙碳目標具有重要意義。因此,在對區域土壤屬性進行空間預測時,應充分考慮當地自然環境條件以及社會經濟條件的影響,選取最合適的預測方法,將多種空間預測方法相結合,以此來提升土壤屬性的預測精度,促進土壤生態系統的健康發展。

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責任編輯:李菊馨

第一作者:梁瑞琳,在讀本科生,研究方向為農業遙感,E-mail:749968515@qq.com。

收稿日期:2023-09-16

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