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耐藥性結核快速診斷的研究進展

2013-04-06 02:22王明芹綜述許卓文審校
河北醫科大學學報 2013年6期
關鍵詞:密碼子抗酸噬菌體

王明芹(綜述),許卓文(審校)

(1.武警河北總隊醫院門診部,河北石家莊050081;2.河北醫科大學期刊社臨床薈萃編輯部,河北石家莊050017)

·綜 述·

耐藥性結核快速診斷的研究進展

王明芹(綜述)1,許卓文(審校)2

(1.武警河北總隊醫院門診部,河北石家莊050081;2.河北醫科大學期刊社臨床薈萃編輯部,河北石家莊050017)

結核;抗藥性;診斷技術和方法;綜述文獻

2007年世界衛生組織統計初治肺結核患者中,耐多藥結核?。╩ultidrug-resistant tuberculosis,MDRTB)占2.9%,復治患者中,MDR-TB占15.3%,耐藥與既往治療密切相關,任意耐藥的比例可能要高出未治療患者4倍,MDR-TB可能要高出10倍。全球每年新出現30~60萬MDR-TB患者,其中24%在中國[1]。我國衛生部2010年4~7月組織全國31省、自治區、直轄市開展的第5次結核病流行病學調查也顯示,我國肺結核患者耐多藥率為6.8%,根據本次調查估算的我國現有的患者數,MDR-TB患者為33.9萬,廣泛耐藥患者為10.5萬,與其他國家相比仍十分嚴重[2]。MDR-TB的產生直接影響到化療的失敗,MDR-TB已經成為了結核病防治中的一大難題,現將耐藥結核的定義、快速診斷的研究進展綜述如下。

1 耐藥結核的定義

全國多耐藥結核病學術會議(1997年9月15—18日廈門)將MDR-TB定義為對異煙肼(H)、利福平(R)、比嗪酰胺(Z)、乙胺丁醇(E)、鏈霉素(S)5種主要抗結核藥中任何2種及2種以上產生耐藥者??紤]到耐HR在臨床上的重要性,建議單獨統計至少已經耐HR的情況。過去對MDR-TB的譯名也比較混亂,有“多種耐藥結核病”、“多重耐藥結核病”等,經會議討論,認為“耐多藥結核病”一詞比較貼切,其他相關名詞統一為“耐多藥結核分枝桿菌”、“耐多藥菌株”、“耐多藥病例”等。自1998年始,《中華結核和呼吸雜志》統一采用上述名詞[3]。

2 顯微鏡觀察藥物敏感性檢測(m icroscopic observation drug susceptib ility,MODS)技術

傳統的結核菌耐藥檢測方法需時較久,普通的培養加藥敏試驗需要2個月時間,遠不能滿足診治的需求,檢測患者結核菌的耐藥譜是治療的必要條件,早期得到耐藥信息對治療更有意義。MODS是近幾年發展起來的一種新的結核病病原學診斷方法,此方法2000年由Cavieds建立,根據結核分枝桿菌在液體培養基上形成特征性索狀結構的特性,將痰、胸腔積液、腦脊液標本直接接種在液體培養基中,一般采用24孔細胞培養板,先在24孔細胞培養板內加入MODS培養基,然后取標本重懸液接種于培養板中,每個樣本設陰性對照(液體培養基)、陽性對照(MTU標準菌株H37Rv)。標本孔再分別加入異煙肼、利福平、鏈霉素、乙胺丁醇等抗結核藥,經37℃、10%CO2的培養箱進行培養。每天觀察1次。在倒置顯微鏡下觀察索狀生長情況,若試驗孔出現結核分枝桿菌特征性的索狀結構即取此部分培養物進行抗酸染色鑒定,若抗酸染色發現抗酸桿菌則判定為MODS培養陽性,說明結核菌在有抗結核藥存在的情況下還能生長,視為有耐藥性,若接種40d后仍未觀察到結核分枝桿菌特征性的索狀結構出現則判定為陰性[4]。此方法具有快速、敏感、檢測成本低的優勢,不需要特殊儀器,操作安全,對預防耐藥結核菌的傳播、防止實驗室工作人員的感染具有重要意義,正在被國內逐漸認識并應用。但此法的缺點是觀察時間長了會導致觀察者視覺疲勞,

還有臨床常見的2種非結核分枝桿菌——恥垢分枝桿菌和堪薩斯分枝桿菌亦具有索狀生長特征,陸俊梅等[5]對MODS培養基進行了改良,在培養基中加入了對硝基苯磺酸,若對照孔有明顯索結構細菌狀生長,硝基苯磺酸含藥孔有細菌生長,則說明標本中有非結核分枝桿菌,若對照孔內有細菌生長,但無索狀結構,判斷為污染。若對照孔有明顯索狀結構細菌生長,加藥孔內無索狀結構生長則判定為該菌株對該藥物敏感,反之,則判定該菌株對該藥物耐藥。黃自坤等[4]對264例肺結核臨床疑似患者的痰標本和20例肺結核病患者的痰標本分別采用抗酸染色法、羅氏培養基(L-J)培養法和MODS技術進行結核分枝桿菌的檢測。結果3種方法檢測20例非結核病患者痰標本結果均陰性;在264例肺結核臨床疑似患者的痰標本中,3種方法的陽性率分別為抗酸染色法28.8%、L-J培養法36.0%、MODS技術的陽性檢出率42.8%,其中在102例抗酸染色和(或)LJ培養陽性的痰標本中,MODS檢出97例(95.1%),在162例抗酸染色和L-J培養均為陰性的標本中,MODS陽性16例;若以臨床診斷為標準,3種方法敏感度和特異度分別為MODS 63.4%和97.8%、L-J培養法54.3%和100%、抗酸染色法43.3%和100%,MODS的陽性檢出中位時間為10d,明顯短于L-J培養的25d。認為MODS技術與傳統病原學檢測方法相比,具有敏感度高、檢出時間短的優勢,適用于結核病的臨床快速診斷。兒童結核往往癥狀不典型,痰標本留取困難,在抗酸染色陰性的患兒標本中,用MODS技術檢測胃抽吸物、鼻咽抽吸物和糞便標本同樣可以獲得快速、高效的檢測結果[6]。陳俊林等[7]應用MODS技術分離到32株耐左氧氟沙星的耐藥結核分枝桿菌,再經過基因測序,32株均有21位密碼子精氨酸-脯氨酸(CGA-CCA)突變和95位密碼子絲氨酸-蘇氨酸(AGC-ACC)突變,還有94位密碼子天冬氨酸-組氨酸(GAC-CAC)、天冬氨酸-甘氨酸(GAC-GGC)、天冬氨酸-丙氨酸(GAC-GCC)、絲氨酸-天冬酰胺(GAC-AAC)突變,90位密碼子天冬氨酸-甘氨酸(GAC-GGC)、GAC-TAC突變和91位密碼子TCGCCG突變。其中,MODS技術選擇出耐藥分枝桿菌,DNA測序鎖定突變位點。

3 BACTEC MGIT 960培養系統

BACTECMGIT 960是新一代產品,具有快速分離培養結核分枝桿菌和其他分枝桿菌的優勢[8],基本原理是在培養瓶的底部樹脂中包被有對培養基中的氧有高度敏感的熒光指示劑,此指示劑在有氧氣存在時被抑制,當結核分枝桿菌生長使氧氣消耗盡時,熒光顯示劑被激活而發出熒光,檢測儀測試熒光強度,并判定結果。儀器每小時自動檢測培養基內細菌對氧消耗所致熒光強度的變化,將測到的熒光強度以生長單位形式報告標本生長情況[8]。此方法比較傳統的培養法操作簡便,培養陽性率高于L-J法,缺點是無法觀察菌落,污染率略高于L-J法,產品依賴進口(美國BD公司產品),價格較貴。陳小蓉等[9]用BACTEC MGIT 960培養系統和L-J法檢測了179例標本(178份痰,1份頸淋巴結穿刺物),BACTEC MGIT 960培養系統陽性標本培養時間9.5d,藥敏所需時間6.7d,L-J法為31.7d和28.0d(P<0.01)。但2種方法的藥敏結果差異無統計學意義。

4 噬菌體生物擴增(phage amp lified biologically assay,PhaB)法

分枝桿菌噬菌體是一種專門寄生于分枝桿菌的DNA病毒,具有嚴格的宿主特異性,并且只能感染活菌,分枝桿菌感染噬菌體后被裂解,釋放出子代噬菌體,子代噬菌體又可以感染隨后加入的指示細胞(恥垢分枝桿菌),如指示細胞被裂解,就會在瓊脂平板上出現透亮的噬菌斑,沒有感染結核分枝桿菌的噬菌體則被其后加入的噬菌體殺滅劑滅活,已進入感染細菌的噬菌體不受影響,根據噬菌斑的有無和多少可以判斷是否為結核分枝桿菌[10]。從標本采集到判讀結果只需18~24h,此法敏感度高,如痰涂片抗酸染色需>5 000條/mL結核菌才能查到陽性,而PhaB法>100條/mL就能查到;特異度達99%以上,僅對結核分枝桿菌敏感,而對非結核分枝桿菌不敏感;此外,其檢測不需昂貴的儀器,試劑盒中含有全部檢測試劑,結果用肉眼即可判讀,特別適合涂片陰性、培養陽性的患者,被認為是開創了結核分枝桿菌微生物檢測的新紀元。馮爽等[11]將135例臨床確診為結核病的患者標本(痰、胸腔積液、肺泡灌洗液、腦脊液)和排除結核病患者的67例上述標本同時做了PhaB法、BACTEC MGIT培養法、涂片法,并對3種方法進行了比較,3種方法的檢出率分別為PhaB法48.2%(65/135),涂片法28.2%(38/135),BACTEC MGIT培養44.4%(60/135),PhaB法高于涂片法(P<0.05)。此法可以檢測胸腔積液、腹腔積液、腦脊液、尿液、脊髓等多種標本;可用于結核病的試驗診斷、抗結核治療效果的評價、初診患者的鑒別診斷以及對人類免疫缺陷病毒感染高危人群的鑒別診斷。

5 聚合酶鏈式反應-單鏈構象多態(polym erasechain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)

PCR-SSCP技術能檢測結核分枝桿菌分離株的多種耐藥遺傳標志,結核桿菌的耐異煙肼、利福平和乙胺丁醇主要與過氧化氫酶編碼的katG基因、aphC啟動子、inhA操縱子、kas A基因有關,乙胺丁醇耐藥與embA、B、C基因有關[12],有的甚至katG基因缺失,正常情況下,利福平與RNA聚合酶B亞基(rpoB)特異性結合,阻斷RNA的合成而起到抑制細菌生長的作用?;蛲蛔兒髍poB亞基構象會發生改變,從而降低與利福平的親和力??焖贆z測出這些基因是否突變,對臨床判斷是否耐藥將具有重大意義。PCR-SSCP原理是根據單鏈DNA片段呈復雜的空間折疊構象,當有一個堿基發生改變時,就會影響其空間構象,空間構象有差異的單鏈DNA分子在聚丙烯酰胺凝膠電泳中受阻大小不同,因此,通過非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,可以非常敏銳地將構象有差異的分子分離開,PCR-SSCP比PCR更為簡便、快速、靈敏,近幾年被大量應用。

6 限制性片段長度多態性聚合酶鏈反應(polymerase china reation-restriction fragment length polymorphyism,PCR-RFLP)

PCR-RFLP也是在PCR基礎上發展起來的,DNA堿基置換正好發生在某種限制性內切酶識別位點上,使酶切位點增加或消失,利用這一酶切性質的改變,PCR特異擴增含堿基置換的這段DNA,經某一限制酶切割,再在利用瓊脂糖凝膠電泳分離酶切產物,與正常比較確定是否變異。如耐乙胺丁醇菌株就存在多位點的突變(以306,328,406,497位4個密碼子多見),導致2個以上不同的氨基酸被置換而耐藥,embB基因(尤其是306位密碼子)突變是結核菌耐乙胺丁醇產生的主要原因[13-15]。賀紅艷等[16]對確診為結核的50株結核菌進行了PCRRFLP分析,結果只有5株為敏感株,45株異煙肼耐藥株,其中9株對異煙肼單耐藥,余45株為多耐藥,經PCR-RFLP分析,5株敏感菌與H37Rv標準株輕質凝膠電泳條帶一致,45株耐藥株中,有1株被消化成4個片段;又將在PCR-RFLP分析中的異常泳動帶的突變標本,進行DNA測序,其katG基因315位氨基酸密碼子第2位堿基發生點突變,由絲氨酸突變為蘇氨酸,這就是基因的點突變。目前我國應用此種方法的實驗室很多。

生物學技術的發展促進了耐藥結核的實驗室診斷,有些是2項或幾項技術聯合應用,如PCR聯合其他技術,耐藥性結核桿菌的檢出聯合基因測試,不僅找到了耐藥性菌株,也揭示了耐藥性產生的機制,為結核患者的早期治療提供了有利保證,但我國結核病防治工作仍然任重而道遠,需要長期不懈的努力,新的技術需要不斷開發,并應用于臨床。

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(本文編輯:劉斯靜)

R378.911

B

1007-3205(2013)06-0742-03

2013-03-25;

2013-04-02

王明芹(1966-),女,河北平山人,武警河北總隊醫院副主任醫師,醫學學士,從事結核病診治研究。

10.3969/j.issn.1007-3205.2013.06.049

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