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貴州省漢族人群類風濕關節炎患者TRAF1/C5基因多態性研究*

2015-03-21 05:39梁愛鳳
國際檢驗醫學雜志 2015年3期
關鍵詞:單倍體類風濕等位基因

梁愛鳳,費 櫻

(1.復旦大學附屬中山醫院青浦分院檢驗科,上海 201700;2.貴陽醫學院附屬醫院微生物免疫科,貴州 貴陽 550004)

貴州省漢族人群類風濕關節炎患者TRAF1/C5基因多態性研究*

梁愛鳳1,費 櫻2△

(1.復旦大學附屬中山醫院青浦分院檢驗科,上海 201700;2.貴陽醫學院附屬醫院微生物免疫科,貴州 貴陽 550004)

目的探討腫瘤壞死因子受體相關因子1(TRAF1)/補體5(C5)單核苷酸多態性與類風濕關節炎(RA)的相關性。方法提取300例RA患者(RA組)和300例健康者DNA(對照組),實時熒光定量PCR方法檢測TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488的單核苷酸多態性。結果TRAF1/C5存在基因多態性,但RA組與對照組比較基因多態性位點的單倍體基因型和等位基因頻率的差異均無統計學意義(P>0.05)。連鎖不平衡分析發現rs3761847與rs10818488之間存在強連鎖不平衡。rs3761847位點A等位基因與類風濕因子(RF)陰性(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41~0.79),抗CCP抗體(抗-CCP)陰性(P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35~0.76)及抗Sa抗體陰性均相關(P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55~0.94);rs10818488位點G等位基因僅與RF陽性相關(P=0.01,OR=1.40,95%CI:1.09~1.81)。結論TRAF1/C5基因多態性可能與貴州漢族人群RA的遺傳易感性無關。

腫瘤壞死因子受體相關因子; 補體; 單核苷酸多態性; 類風濕關節炎

類風濕關節炎(RA)是一種系統性自身免疫性疾病,其病因尚不明確,遺傳、環境和免疫因素共同發揮作用。RA作為一種多基因遺傳疾病,目前已知的RA易感基因主要有腫瘤壞死因子(TNF)、人類白細胞抗原(HLA)-DR、白細胞介素(IL)及肽?;彼崦搧啺访福?(PADI4)等。已有報道表明位于9號染色體短臂33-34位點的腫瘤壞死因子受體相關因子(TRAF1)/補體5(C5)基因是RA的易感基因,且與抗環瓜氨酸肽(CCP)抗體陽性相關[1],而后者是RA早期診斷、病情評估和療效檢測的有效指標之一。RA的遺傳異質性使得不同人種之間的遺傳學研究結果常不一致。本研究首次以貴州漢族人群為研究對象,通過實時熒光定量PCR(Real-time PCR)方法檢測TRAF1/C5基因多態性,并探討該基因與RA患者相關血清學指標之間的關系,旨在探討該基因與貴州漢族人群RA患者遺傳易感性之間的關系。

1 資料與方法

1.1 一般資料 收集2011年10月至2013年1月貴陽醫學院附屬醫院腎內科門診及病房的300例RA患者全血,均為漢族,其中男性72例、女性228例,平均年齡(50.3±14.6)歲,所有RA病例均符合美國風濕病學會(ACR)和歐洲抗風濕聯盟(RULAR)2010年聯合推出的類風濕性關節炎診斷標準[2];按照民族、年齡和性別匹配的原則選取健康體檢者300例作為對照組,其中男性66例,女性234例,平均年齡(50.5±14.1)歲,均排除其他自身免疫性疾病及腫瘤等。所有納入對象均為無血緣關系的個體。

1.2 方法

1.2.1 基因組DNA的提取 酚-氯仿法提取受檢者外周血DNA,檢測純度和濃度后-20℃保存。

1.2.2 Real-time PCR SNP分型 采用Taqman-MGB探針對TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488位點進行基因分型,所用Real-time PCR探針購自ABI公司。在羅氏LightCycler?480Real-time PCR儀上進行反應。

1.2.3 血清學指標檢測 檢測RA組類風濕因子(RF)、抗CCP抗體(抗-CCP)和抗Sa抗體(抗-Sa)三項血清學指標,采用RF膠乳凝集法測定試劑盒(購自上海捷門生物技術合作公司)檢測RF水平,抗環瓜氨酸肽(CCP)抗體酶聯免疫檢測試劑盒(購自上??菩律锛夹g股份有限公司)檢測抗-CCP水平,抗Sa抗體IgG酶聯免疫吸附法檢測試劑盒(購自歐蒙醫學診斷技術有限公司)檢測抗-Sa水平。

1.3 統計學處理 采用SPSS 13.0統計軟件對結果進行分析。計算兩組各個基因型及等位基因頻率,并進行Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗,各組基因型及等位基因頻率的比較采用χ2檢驗,P<0.05為差異有統計學意義,同時計算比值比(OR)和95%置信區間(95%CI)。用SHEsis在線分析軟件對TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488兩個位點進行連鎖不平衡分析。

2 結 果

2.1 TRAF1/C5基因與RA相關性分析 在貴州漢族RA患者中,TRAF1/C5基因的兩個單核苷酸多態性(SNPs)位點均符合Hardy-Weinberg平衡。與對照組比較,RA組兩個SNPs位點基因型頻率分布差異均無統計學意義(P>0.05),見表1。

2.2 連鎖不平衡和單倍體基因型分析 對rs3761847和rs10818488兩個SNPs位點的基因型信息在對照組中進行連鎖不平衡分析,發現這兩個位點存在高度連鎖不平衡(D′=1.000,r2=0.852),見附圖1(見《國際檢驗醫學雜志》網站主頁“論文附件”)。理論上這兩個位點共可組成4種單倍體基因型,筆者對其中頻率大于0.03的3種單倍體基因型進行了進一步的分析比較:在對照組和RA組中3種單倍體基因型的分布無統計學差異(P>0.05),見表2。

2.3 TRAF1/C5基因與RF、抗-CCP、抗-Sa水平的相關性分析 與對照組相比,rs3761847位點A等位基因與RF陰性(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41~0.79),抗-CCP陰性(P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35~0.76)及抗-Sa陰性相關(P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55~0.94),rs10818488位點G等位基因僅與RF陽性組相關(P=0.01,OR=1.40,95% CI:1.09~1.81),見表3、4。

3 討 論

TRAF1介導TNF受體1、2和CD40參與的信號轉導途徑,而TNF是RA發病機制中的重要細胞因子[3]。TRAF1還與T細胞的活化增殖有關[4],TRAF1基因敲除的小鼠T細胞過度增殖或受到T細胞受體復合物刺激時過度增殖以應答TNF。TRAF1在這些信號轉導途徑中起到負調節作用以維持炎癥反應的環境[5],從而在RA中發揮作用。雖然TRAF1在多種受體介導的信號通路中起作用,但TRAF1的分子機制還沒有完全闡明,其在RA中作用有待于進一步研究。補體途徑也參與了RA的發病,C5裂解成促炎癥反應的C5a和C5b,進而啟動攻膜復合物的形成。RA患者關節滑液持續的炎癥反應與高水平的C5a同時存在[6]。小鼠模型研究證實了C5基因是RA的候補基因,同時證明了C5缺陷的小鼠可抵抗炎性關節炎,表明了C5基因在炎癥反應中的作用[7-8]。因此,C5在RA發病機制中可能通過上調RA患者關節腔內補體活化程度來起作用。

本研究發現TRAF1/C5的兩個SNPs存在基因多態性,但RA組與對照組相比差異無統計學意義(P>0.05),可能與貴州漢族人群RA易感性無關,這一結果與其他人種研究結果不盡相同[1,9-10]。這一情況說明了RA的遺傳異質性,不同人種之間遺傳學研究結果常不相同。經連鎖不平衡分析發現TRAF1/C5兩個SNPs位點在對照組人群中呈現高度連鎖不平衡(D′=1.000,r2=0.852),與HapMap發布的數據基本一致(r2=1),但構建的單倍體基因型則與RA發病不相關(P>0.05)。由于國內外大量的病例-對照研究均局限于驗證基因與RA患者的關聯性,較少涉及這些多態性位點的單倍體基因型,因此單倍體基因型與RA的關系有待于不同種族、大樣本量的研究證實。另外本研究還發現TRAF1/C5基因rs3761847位點A等位基因與RF陰性、抗-CCP陰性及抗-Sa陰性相關,這表明該位點可能增加自身抗體陰性RA者的易感性;rs10818488位點G等位基因僅與RF陽性相關,表明該位點可能在RF陽性者RA的發病中起重要作用,但是受到標本量的影響,這些結果還有待于進一步加大樣本量進行分析,目前的研究結果也存在爭議[1,9]。

本研究首次以貴州漢族人群為研究對象,結果顯示TRAF1/C5SNPs基因型或多態性位點可能與貴州漢族人群RA的發病無關,可能是由于受到樣本量較小,TRAF1/C5 SNPs單倍體基因型及等位基因與RA患者血清學指標之間的關系沒有得到很好的證實。

[1]Plenge RM,Seielstad M,Padyukov L,et al.TRAF1-C5as a risk locus for rheumatoid arthritis-agenomewide study[J].N Engl J Med,2007,357(12):1199-1209.

[2]Aletaha D,Neogi T,Silman AJ,et al.2010rheumatoid arthritis classification criteria:an American College of Rheumatology/European League Against Rheumatism collaborative initiative[J].Arthritis Rheum,2010,69(9):2569-2581.

[3]Firestein GS.Evolving concepts of rheumatoid arthritis[J].Nature,2003,423(6937):356-361.

[4]Sabbagh L,Srokowski CC,Pulle G,et al.A critical role for TNF receptor-associated factor 1and Bim down-regulation in CD8 memory T cell survival[J].Proc Natl Acad Sci U S A,2006,103(49):18703-18708.

[5]Tsitsikov EN,Laouini D,Dunn IF,et al.TRAF1is a negative regulator of TNF signaling:enhanced TNF signaling in TRAF1-deficient mice[J].Immunity,2001,15(4):647-657.

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Association of the TRAF1/C5 gene polymorphism with rheumatoid arthritis in Han population of Guizhou Province*

Liang Aifeng1,Fei Ying2△
(1.Department of Clinical Laboratory,Qingpu Branch of Zhongshan Hospital Affiliated to Fudan University,Shanghai 201700,China;2.Department of Clinical microbiology and Immunology,the Affiliated Hospital of Guiyang Medical College,Guiyang,Guizhou550004,China)

ObjectiveTo explore the association between the tumor necrosis factor receptor-associated factor 1(TRAF1)/complement component 5(C5)single nucleotide polymorphism and rheumatoid arthritis patients.MethodsTwo groups of people were included in the study:300rheumatoid arthritis(RA)patients(RA group)and 300healthy individuals(control group).Real-time PCR was used to test the single nucleotide polymorphisms rs3761847and rs10818488of TRAF1/C5.ResultsThere was no significant difference(P>0.05)of TRAF1/C5rs3761847and rs10818488polymorphism between the two groups.The linkage disequilibrium analysis results showed that there was strong linkage disequilibrium between rs3761847and rs10818488.For the RF,anti-CCP and anti-Sa negative RA patients,the difference in the frequency of A allele of rs3761847between the RA patients and matched controls was statistically significant(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41-0.79;P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35-0.76;P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55-0.94).Significant difference for the frequency of G allele of rs10818488between RF positive RA patients and control groups was observed(P=0.01,OR=1.40,95%CI:1.09-1.81).ConclusionTRAF1/C5gene polymorphism may not associate with susceptibility of RA patients in Han population in Guizhou.

tumor necrosis factor receptor-associated factor; complement component; single nucleotide polymorphisms;rheumatoid arthritis

10.3969/j.issn.1673-4130.2015.03.010

A

1673-4130(2015)03-0310-03

2014-11-10)

貴陽市科技計劃項目[(2010)筑科農合同第1-社-17號]。 作者簡介:梁愛鳳,女,檢驗技師,主要從事分子生物學檢測方面的研究?!?/p>

,Email:645903661@qq.com。

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