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Niemann-Pick C1蛋白在埃博拉病毒感染中的作用及其靶向藥物研究進展

2024-03-07 06:31吳海燕陳國江
中國藥理學與毒理學雜志 2024年2期
關鍵詞:絲狀結構域膽固醇

吳海燕,陳國江

(軍事科學院軍事醫學研究院毒物藥物研究所,北京 100850)

埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)屬于絲狀病毒科,絲狀病毒科主要分為EBOV 屬、馬爾堡病毒(Marburg virus,MARV)屬和奎瓦病毒屬。EBOV屬包括EBOV、本迪布焦病毒、萊斯頓病毒、蘇丹病毒和塔伊森林病毒[1]。自1976年在非洲大陸被發現以來,EBOV 已在非洲引起多次致命出血性疾病的暴發,給世界公共衛生帶來巨大挑戰[2]。EBOV的主要感染途徑有直接接觸感染、醫源性接觸感染、性傳播和母嬰傳播,感染EBOV 可引起發熱、頭痛和肌痛等癥狀,最后發展為肝、腎功能衰竭,導致死亡[3]。埃博拉病毒?。‥bola virus disease,EVD)的暴發主要在非洲國家,在2013年至2016年西非暴發的疫情中,報告病例約28 000 例,死亡高達約11 000 例[4]。盡管目前已有多個治療EVD 的候選藥物,但考慮到病毒的高頻突變性,開發靶向絲狀病毒的廣譜治療藥物仍有迫切的現實需求。

1 Niemann-Pick C1在EBOV感染中的作用

EBOV 是一類單鏈負義RNA 病毒,其基因組編碼7 種蛋白,分別為核蛋白、聚合酶輔因子、基質蛋白、糖蛋白(glycoprotein,GP)、轉錄激活因子、次要基質蛋白和RNA 依賴的RNA 聚合酶[5]。EBOV 利用多種宿主因子進入細胞,包括去唾液酸糖蛋白受體、C 型凝集素、T 細胞免疫球蛋白黏蛋白結構域1和β1 整合素等[6-7]。EBOV 表面蛋白GP 為單一的包膜糖蛋白,介導病毒附著、進入與膜融合。GP 分子以同源三聚體形式存在于病毒粒子表面,每個單體由二硫鍵連接的GP1 和GP2 亞單位異源二聚體組成。GP 介導EBOV 進入靶細胞,與宿主細胞膜相互作用觸發病毒顆粒內吞。GP1 包含受體結合位點(receptor binding site,RBS)、聚糖帽和黏蛋白樣結構域,而GP2 包含融合環和跨膜結構域[8]。在病毒與細胞表面黏附因子(如C 型凝集素)結合后,EBOV 通過胞吞作用進入細胞[9-11]。在晚期內體中,GP 被宿主組織蛋白酶(如組織蛋白酶L 和B)切割為酶裂解GP(cleaved GP,GPcl),去除聚糖帽和黏蛋白樣結構域,進而暴露RBS[12]。RBS 與內體膜上的膽固醇轉運蛋白Niemann-Pick C 1(NPC1)結合,促進GP2 介導的病毒膜與內體膜融合。隨后,病毒RNA 釋放到胞質中,完成復制等步驟[13-15]。

近期研究發現,NPC1 是絲狀病毒感染靶細胞的關鍵受體。NPC1蛋白是溶酶體和內體膜上的膽固醇轉運體,人NPC1 蛋白包含1278 個氨基酸殘基,包括1 個N 端結構域(N-terminal lumenal domain,NTD)、1 個中間結構域(middle luminal domain,MLD)、1個C端結構域(C-terminal lumenal domain,CTD)和13 個跨膜段(transmembrane segments,TM),TM3~7 片段被稱為甾醇傳感結構域(sterol-sensing domain,SSD)[16](圖1)。MLD主要由中心的7個α螺旋作為核心和圍繞核心的7個β 鏈組成,并有2 個突出的環。第一突出環(loop1)位于β2 和β3 鏈之間,而第二突出環(loop2)位于α4 和α5 螺旋線之間。MLD 利用2 個突出環結合GPcl 頭部的疏水空腔,GPcl 是EBOV 進入內體被組織蛋白酶切割后的GP,能暴露出RBS。EBOV GPcl和NPC1-MLD 之間的分子相互作用由NPC1-MLD的2個突出環介導,它們與GPcl頭部RBS中的疏水口袋結合。在第一突出環中,7 個殘基Y420,Q421,Y423,P424,S425,G426 和D428 參與相互作用,其中殘基Y423 和P424 參與大部分原子間的接觸。在第二突出環中,6 個殘基D501,D502,F503,F504,V505 和Y506 參與結合過程,殘基F503,F504 和Y506 通過與GPcl 頭部空腔的緊密疏水相互作用發揮主要作用(圖2)。在酶切并與MLD 結合后,GPcl 的構象變化進一步影響內部融合環的狀態,觸發膜融合。疏水相互作用主要有助于在MLD 和EBOV-GPcl 之間的接觸表面水平上,穩定蛋白質-蛋白質復合物[17-18]。

圖1 埃博拉病毒(EBOV)入侵宿主細胞的過程[17].NTD:Niemann-Pick C1(NPC1)蛋白N端結構域;MLD:NPC1蛋白中間結構域;CTD:NPC1 蛋白C 端結構域;Loop1:第一突出環;GPcl:酶裂解糖蛋白.

圖2 NPC1-MLD與GPcl復合結構[17].

NPC1基因的缺失會使細胞內膽固醇堆積,導致一種嚴重的神經退行性疾病,稱為尼曼-匹克C型疾?。∟iemann-Pick disease type C)[19-20]。NPC1與NPC2 共同介導膽固醇的轉運。NPC2 結合到NPC1 的MLD 后將膽固醇轉移到NTD,MLD 與NPC2 的主要作用殘基為R404 和R518(圖3)。R518 暴露在MLD 頂部的短螺旋α3 末端,R404 埋在MLD 中,與TM3 N 端莖部分的E606 相互作用[16]。CTD 的所有8 個半胱氨酸形成4 個二硫鍵,其中C909~C914 形成1 個特定環,該環反過來介導與NTD 的相互作用[21-22]。之后NTD 從NPC2 接收到膽固醇,并將膽固醇轉移到膜上的SSD 區域[23]。值得注意的是,NPC1 在EBOV 入胞中的作用與其在膽固醇外排中的功能相互獨立,為病毒進入的治療性抑制劑的設計提供了分子基礎[15,24]。NPC1蛋白作為目前已知的絲狀病毒的共同進入受體,靶向NPC1的藥物可能具有廣譜抗絲狀病毒作用。

圖3 NPC1與NPC2結合的關鍵位點[16].

2 靶向NPC1的藥物

目前抗病毒治療大多針對病毒本身,由于病毒具有高頻突變的特性,一段時間后這些治療方法往往失效或耐藥。針對病毒識別的關鍵宿主分子開發藥物具有廣譜性、不易誘發變異等優點,且在阻斷病毒與宿主相互作用的同時,還能調節宿主的免疫反應,增強抗病毒功效[25]。目前,NPC1已成為抗EVD 藥物研發領域頗具吸引力的靶點。NPC1 已被證實在其他病毒感染中也起重要作用。NPC1能與嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒2 核蛋白相互作用,增強其感染性,抑制NPC1夠顯著減輕其引起的病變[26-27]。此外,研究還發現,NPC1也涉及如丙肝病毒[28]、人類免疫缺陷病毒[29]、基孔肯雅病毒[30]、登革熱病毒[31]、寨卡病毒[32]和桿狀病毒[33]等感染。由于NPC1 為多種包膜病毒的共同受體,靶向NPC1的抑制劑可能成為廣譜抗病毒候選藥物。針對NPC1 的藥物主要包括小分子抑制劑、單克隆抗體以及基因治療藥物,在非臨床研究中展示了較好活性。

2.1 小分子抑制劑

2.1.1 直接作用于NPC1

一類化合物,如金剛烷二肽哌嗪、磺胺、三唑硫醚、咔唑和硫化物等,可結合到NPC1 上與GPcl 結合的位點,競爭性阻斷GP與膜的結合(表1)。

表1 抗EBOV NPC1-C-GPcl相互作用的化合物

金剛烷二肽哌嗪系列包括化合物3.0 和化合物3.47,能識別NPC1 在絲狀病毒進入過程中的關鍵作用,干擾NPC1-GP 相互作用[34]?;衔?.0 半數抑制濃度(half inhibitory concentration,IC50)為1.6 μmol·L-1,而化合物3.47的IC50低至130 nmol·L-1。通過改進化合物3.47 體外藥動學特性獲得的衍生物3.23和3.24,比3.47更有效,疏水性更低,且對導致人類感染大暴發的Mayinga EBOV(1976年)和Makona EBOV(2014年)具有很強抑制活性,其對Makona EBOV的半數效應濃度(half maximal inhitory concentration,EC50)分別為52 和17 nmol·L-1,對Mayinga EBOV 的EC50值分別為33 和35 nmol·L-1[35],但小鼠體內實驗顯示,這類化合物并未提高小鼠生存率。

Basu 等[36]發現了2 種分別基于磺胺和三唑硫醚骨架的小分子氨基乙酰胺磺酰胺MBX2254和三唑硫醚MBX2270,兩者能在病毒入胞后的晚期內體中抑制EBOV-GP 與NPC1-MLD 相互作用,在體外對EBOV 的IC50分別為8.07 和10.00 μmol·L-1,半數細胞毒性濃度(half cytotoxic concentration,CC50)均>50 μmol·L-1,且兩者與NPC1-MLD 的結合誘導構象變化,阻斷NPC1 的膽固醇轉運。另外,Lasala 等[37]運用虛擬篩選方法獲得具有病毒抑制活性的7 種化合物,分別屬于苯并噻唑(9,12,19和30)、咔唑(SC2)和硫化物(14 和26)衍生物。在EBOV假病毒感染實驗中,二芳基硫化物(14和26)的IC50分別為4.69 和2.04 μmol·L-1,SC2 的IC50為0.37 μmol·L-1,均顯示出較好的抗病毒活性。ELISA結果顯示,這些化合物抑制EBOV-GPcl 和NPC1-MLD 之間的相互作用,而苯并噻唑類藥物不影響NPC1-GP的相互作用。

Wang 等[38]采用計算機方法在化合物庫中針對NPC1 與GP 相互作用的RBS 區域篩選出化合物A 和U,及其類似物A3 和A4 及U6 和U7,它們對EBOV 和MARV 感染均表現出較強抑制活性。在體外假病毒實驗中,化合物A 對MARV 的IC50值最低(0.86 μmol·L-1),化合物A3 對EBOV 的IC50值最低(3.87 μmol·L-1)。對于EBOV 和MARV,化合物U 的IC50值分別為12.38 和21.72 μmol·L-1。在細胞毒性實驗中,化合物A 顯示出更大毒性,CC50值為3.91 μmol·L-1,而化合物U 表現出較低細胞毒性,其CC50值接近100 μmol·L-1。在EBOV 真毒實驗中,化合物A 和U 均顯示較強抑制活性,IC50值分別為11.92和8.77 μmol·L-1。

另一類化合物與NPC1 上的其他位點結合,使其無法在晚期內體正常表達,影響GPcl與NPC1的結合。以雄烯酮衍生物U18666A(表1)為例,它是一種兩親性類固醇,能抑制溶酶體膜蛋白NPC1 轉運膽固醇,導致膽固醇在溶酶體中累積[39]。盡管U18666A 和丙咪嗪(imipramine)治療均可使感染EBOV 小鼠的病毒復制降低,但未顯示出明顯保護作用[24]。先前的研究結果也表明,U18666A和三唑類藥物伊曲康唑(itraconazole)(表1)均可阻斷NPC1 介導的膽固醇轉運,對EBOV 感染具有抑制作用。U18666A與伊曲康唑對NPC1的抑制作用位點主要在NPC1-SSD[40],NPC1-SSD的P691S突變可以阻止NPC1蛋白與這些配體的結合[41-42]。

2.1.2 作用于GP間接影響NPC1

除上述化合物外,進入抑制劑(entry inhibitor)還可通過作用于EBOV-GP 的GP1-GP2 界面的融合環水平變構干擾NPC1-MLD-GPcl相互作用。通過使用GP 假病毒,Basu 等[43]在進入抑制劑篩選中發現了苯二氮衍生物化合物7(表1)。與其他RNA和DNA病毒相比,化合物7 在細胞實驗中表現出對EBOV 和MARV 的抑制具有選擇性,IC50值分別為10和12 μmol·L-1。研究表明,化合物7 可與GP1 和GP2 之間界面上的疏水口袋結合,這種與EBOV-GP 的結合會對GP 蛋白在GP1-GP2 二聚表面的穩定性產生負面影響。配體誘導的失穩將隨著EBOV-GP 結構擴散到容納NPC1-MLD 的空腔,最終損害結合位點的蛋白質相互作用。

2.2 單克隆抗體藥物

目前對絲狀病毒抗體藥物的研究主要針對病毒表面GP,在眾多靶向EBOV GP 的單克隆抗體中,較為有效的有3 種,分別是Zmapp,REGN-EB3和mAb114。Zmapp 和REGN-EB3 是治療性混合物,各自含有3 個針對不同表位的單抗,mAb114 是針對EBOV GP 受體結合域的單一治療性單抗;mAb114 與EBOV GP 受體結合域上的一個保守氨基酸區域結合,即使在低pH(如內體中的pH)下仍保持結合,提示mAb114 可阻斷GP 在晚期內體中與宿主細胞受體蛋白NPC1的相互作用[44-45]。無法避免的是,當GP 表位發生突變時,這些靶向EBOV GP 表位抗體的中和效果將大幅下降。但由于這些單抗對嚴重EVD 的治療僅具有中等效力,對其他種類EBOV 無效,因此開展針對所有絲狀病毒科的廣譜抗體藥物研究具有重要意義。

有研究表明,雙特異性抗體(bispecific antibody,BsAb)治療可成為一種很有前景的抗體聯合治療方法。Wec 等[46]開發了一種“特洛伊木馬”(Trojan horse)BsAb,他們分別將以RBS和NPC1-MLD 為靶向位點的單抗MR72 和mAb-548 偶聯靶向GP 表位的單抗FVM09。這類BsAb 能通過FVM09以“搭便車”方式進入感染病毒細胞,并通過MR72 或mAb-548 成功抑制GPcl-NPC1 相互作用。體內實驗也表明,BsAb 對感染了EBOV 或蘇丹病毒的BALB/c 小鼠具有保護作用,與未治療組相比,FVM09-MR72 組小鼠存活率更高(70%),FVM09-548 具有部分保護作用。該方法對EBOV屬病毒提供了廣泛保護,即使在暴露后治療條件下,也可對抗致命的EBOV 攻擊,但該BsAb 不能中和其他絲狀病毒。在此基礎上,該團隊開發了第二代“特洛伊木馬”BsAb,通過與內化細胞表面受體-離子非依賴性甘露糖-6-磷酸受體/胰島素樣生長因子2受體的結合,將抗體內化到細胞中,增強對絲狀病毒進入細胞的阻斷作用[47]。該研究擴展了“特洛伊木馬”BsAb 傳遞機制,具有更加廣譜的抗病毒功能。

2.3 基因治療藥物

Sadewasser 等[48]采取一種基于反義寡核苷酸(antisense oligonucleotides,ASO)作用于NPC1的新方法,對感染了EBOV 的細胞具有體外抑制效果。ASO 是指短的(16~53 個核苷酸)、合成的低聚核苷酸,用于阻斷RNA(包括微RNA)的功能。研究人員選擇NPC1作為鎖定核酸修飾的反義寡核苷酸抑制的治療靶點。在人和小鼠細胞系中篩選ASO,鑒定出的候選寡核苷酸能夠在體外有效敲除NPC1蛋白,敲除效率高達94%,并且不改變細胞活力,其中最有效的ASO 05HM 抑制NPC1 表達的IC50值為668 nmol·L-1。用選出的候選寡核苷酸處理感染EBOV 的HeLa 細胞,病毒滴度顯著降低(>99%),表明針對NPC1 的ASO 是一種有希望的治療方法。另外,Kondoh 等[49]利用國家生物技術信息中心單核苷酸多態性(single-nucleotide polymorphism,SNP)數據庫在人NPC1 中發現了10 個天然存在的錯義SNP,建立了穩定表達NPC1 的具有SNP 替換的Vero E6 細胞系,發現核苷酸的替換導致細胞對絲狀病毒易感性降低。利用NPC1 SNP 雖可使病毒易感性降低,但很有可能會影響NPC1本身的生理功能而產生其他不良反應。

3 結語

全面了解病毒的感染過程如病毒的結構、病毒與宿主的相互作用機制等有利于研發新的抗病毒療法?;诓《颈砦谎邪l的小分子抑制劑及單克隆抗體等能有效抑制EVD 發生。目前,單克隆抗體是EBOV 感染的主要治療藥物,靶向位點主要是病毒表面GP。這些抗體雖表現了良好的中和活性,但仍存在一些問題。①EBOV 為RNA 病毒,易產生突變和逃逸,單克隆抗體容易失效;②靶向病毒表位的抗體不夠廣譜。宿主靶向抗病毒治療能克服這些缺點,但不可避免地導致藥物的一些不良反應。對于EBOV 來說,NPC1 是體內膽固醇的轉運體,抑制NPC1 的藥物雖可降低EVD 發生,但也會影響細胞內膽固醇轉運。如何有效控制EBOV 感染且不影響體內正常NPC1功能是目前該研究領域面臨的一大挑戰。不斷發掘新宿主受體并開發新靶向藥物必將為EVD 治療提供更多選擇,并取得更好治療效果。

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