?

一株抗鎘真菌的鑒定及其抗性的初步研究

2018-06-13 06:40于洪飛
生物學雜志 2018年3期
關鍵詞:孢霉抗性菌落

于洪飛,劉 森

(河南理工大學資源環境學院,焦作 454000)

煤炭作為主要能源,在相當長的時期內,在我國能源結構中的地位不會改變[1]。然而,煤中含有多種有害或潛在有害元素,在其采集、洗選、儲存、運輸過程中,會釋放到周邊環境中[2-3]。郭二果等[4]研究發現與采礦前比,土壤中As、Hg、Cu、Cd等重金屬含量均高于采礦前水平。馬從安等[5]對勝利露天煤礦重金屬含量調查,發現重金屬Cd的含量已經超標。煤礦區土壤中Cd和Pb對人體健康存在健康風險[6],因此,礦區污染土壤的修復顯得尤為重要。在自然界中,微生物在重金屬的遷移、轉化過程中起著重要作用,可對土壤中的重金屬進行固定、移動或轉化,改變它們在土壤中的環境化學行為,可促進有毒、有害物質解毒或降低毒性,從而達到生物修復的目的[7]。

本文采用濃度梯度馴化的方法[8],從校園內長期堆放煤的下層土壤中篩選出對鎘具有較強抗性的真菌,運用傳統形態學方法和18S rDNA序列分析對菌株進行了鑒定,同時研究菌株對Pb2+、Zn2+、Cu2+、Ni2+、Co2+和Cr2+的重金屬抗性,為其實際應用提供參考。

1 材料和方法

1.1 抗鎘菌株的篩選與培養

采用梯度濃度馴化法,從河南理工大學校園內煤場采集土樣,稱取3份土樣各10 g加入到90 mL的馬鈴薯葡萄糖(簡稱PDA)液體培養基(其中Cd2+濃度為100 mg/L)搖床培養3 d(28℃,150 r/min),取培養液10 mL加入到PDA液體培養基(Cd2+濃度為200 mg/L)搖床培養3 d(28℃,150 r/min),依此類推,鎘濃度逐漸遞增,最后Cd2+濃度達到2000 mg/L。取最后一批的培養液,將菌液涂布于鎘離子抗性平板(濃度為2000 mg/L的PDA固體培養基),培養分離菌株。

1.2 形態與分子鑒定

1.2.1 形態鑒定

將1.1分離的菌株接種于PDA平板上,置于28℃下培養5 d,期間觀察菌落的顏色和形態。并在顯微鏡下觀察菌絲、分生孢子梗及分生孢子的形態特征。根據《真菌鑒定手冊》[9]和《植物病原真菌學》[10]進行鑒定。

1.2.2分子鑒定

將菌株接種到PDA液體培養基中,搖床培養(28℃,150 r/min)3 d后抽濾得到新鮮的菌絲體。使用真菌基因組DNA快速抽提試劑盒(No.B518229,上海生工生物工程有限公司)提取基因組。

采用NS1(5′-gTAgTCATATgCTTgTCTC-3′)和NS8(5′-TCCgCAggTTCACCTACggA-3′)兩個通用引物擴增18S rDNA序列[11]。PCR反應體系(25 μL):基因組DNA 0.5 μL,引物 (25 μmol/L)各 1 μL,10×PCR buffer 2.5 μL,dNTP 2.0 μL,Taq酶0.25 μL,MgCl21.5 μL,ddH2O 16.25 μL。PCR反應條件:94℃預變性5 min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸90 s,30個循環;72℃延伸10 min。1%瓊脂糖電泳檢測,采用SanPrep柱式DNA膠回收試劑盒(NO.B518131,上海生工生物工程有限公司)回收目的片段。

利用T4 DNA Ligase將其與pUCm-T 載體連接形成克隆質粒,再將重組質粒轉化到大腸桿菌DH5α感受態細胞中,使用選擇性LB瓊脂平板篩選含重組質粒的白色克隆,提取質粒。通過上海生工生物工程有限公司測序,獲得的序列提交到NCBI數據庫,并應用BLAST 程序與數據庫中已有的基因序列進行同源性比對分析。應用MEGA6.0以N-J方法構建系統發育樹,對菌株進行系統發育分析。

1.3 菌株對其他重金屬的抗性檢測

用MIC(Minimal Inhibitory Concentration,最低抑菌濃度)來表示菌株對重金屬的抗性,MIC值越大,表示菌株對重金屬的抗性越大,反之,抗性越小。分別配制不同質量濃度的Pb2+、Zn2+、Cu2+、Ni2+、Co2+和Cr2+重金屬離子的抗性平板。用打孔器(直徑0.5 cm)從培養好的平板上打取菌落接種于抗性平板上,每個濃度3個重復,倒置培養(28℃)2 d后,開始觀察并記錄菌落直徑,以24 h內菌落直徑變化不顯著的視為不生長,被完全抑制。

2 結果與分析

2.1 鎘抗性菌株的篩選與形態鑒定

采用梯度濃度馴化方法篩選抗鎘菌株,當鎘離子富集濃度達到800~2000 mg/L之間時,發現培養基中只有一種真菌存在,培養液呈清澈透明狀,懸浮著大量表面粗糙的菌絲球,長勢良好,抗性平板培養后,得到一株抗鎘真菌,編號為M2。

菌株M2在PDA平板上初期菌絲為白色,疏松的絨毛狀,培養到72 h,菌落墨綠色絲絨狀,呈放射狀向外擴展,老熟后呈黑色,表面平伏,似氈狀(圖1)。分生孢子梗褐色,有隔,單生或簇生,直或彎曲(圖2-A)。分生孢子暗褐色,彎曲或呈新月形,大小(25~27.5)μm×(10~15)μm,具隔膜3個,大多4胞,中間兩個細胞膨大,其中從基部向上數第3個細胞特別大,顏色深;兩端細胞稍小,顏色淺(圖2-B)。

根據以上特征,菌株M2符合關于新月彎孢霉特征的描述報道[5-6],初步鑒定為新月彎孢霉 (Curvularialunata)。

圖1 菌株M2在PDA平板上的菌落生長狀態Fig 1 The growth state of strain M2 on PDA plate culture medium

圖2 菌株M2的分生孢子梗及分生孢子(40×10)Fig 2 Sporangiophore and conidia of strain M2(40×10)

2.2 分子生物學鑒定

采用試劑盒提取到高純度基因組DNA,并成功擴增出18S rDNA基因(1731 bp)。通過同源性比對發現,M2(GenBank登錄號:KX852423)與Cochltobolussp.,Cochliobolusgeniculatus,Cochlioboluslunatus親緣關系接近,處在同一個大的分支。且與Cochlioboluslunatus(GenBank登錄號:JN941608.1)同源性達100%,序列覆蓋率100%。通過系統發育分析(圖3),鑒定菌株M2屬于真菌界(Fungi)、雙核亞界(Dikarya)、子囊菌門(Ascomycota)、 子囊菌亞門(Pezizomycotina)、座囊菌綱(Dothideomycetes)、格孢菌亞綱(Pleosporomycetidae)、格孢菌目(Pleosporales)、格孢菌科(Pleosporaceae)、旋孢腔菌屬(Cochliobolus)月狀旋孢腔菌(Cochlioboluslunatus)。

圖3 以18S rDNA基因序列為分子標記的系統進化樹Fig 3 The phylogenetic tree based on 18S rDNA sequences

2.3 菌株M2對鎘離子的抗性檢測

菌株M2在鎘濃度500 mg/L到4000 mg/L的平板上均能生長,隨培養時間的延長,各個濃度下菌株M2的菌落直徑均緩慢增加,且隨鎘濃度的逐漸提高,菌株生長速度緩慢,菌落直徑增加的幅度變小(圖4)。鎘濃度在500~2000 mg/L時,菌落直徑在24 h內變化明顯,而高于2000 mg/L時,菌落直徑在24 h內增長幅度較小。當鎘濃度為4000 mg/L時,鎘抑制作用增強,菌落直徑增長不明顯??梢?,鎘對菌株M2的最低抑菌濃度為4000 mg/L。同時還發現,在鎘抗性平板上的菌落中央菌絲體呈現灰色,邊緣乳白色,菌絲體緊密有褶皺,并分泌有褐色色素滲入培養基中,菌絲表面不易形成粉末狀孢子。

2.4 菌株M2對其他重金屬的抗性檢測

用MIC來表示菌株M2對鉛、銅、鋅、鎳、鈷和鉻的抗性。隨著重金屬濃度的增加,菌株M2對各個重金屬表現出不同的耐受性。低濃度的鉛對M2的抑制作用不明顯,當鉛質量濃度大于1000 mg/L時,抑制作用增強,鉛質量濃度達到1500 mg/L時,菌株生長被抑制,菌落直徑24 h內基本不變(圖5-A),菌株M2對鉛具有很強的抗性。菌株對鋅、銅抗性也較強,當鋅和銅質量濃度分別達到600 mg/L和400 mg/L時,基本抑制了M2的生長(圖5-B、C),鋅抗性平板上,菌落周圍亦產生褐色色素滲入培養基中。銅抗性平板上的菌落顏色偏深藍綠色。重金屬鎳、鈷、鉻對菌株的毒害作用較強,當鎳、鈷、鉻的質量濃度分別為100、80和60 mg/L時,M2的菌落直徑比接種時直徑(0.5 cm)只增加0.2~0.5 cm,可能是借助接種時帶入的培養基才有少量增長(圖5-D、E、F)。由圖5的抗性結果可知,鉛、鋅、銅、鎳、鈷和鉻對菌株M2的最低抑菌濃度分別為1500、600、400、100、80和60 mg/L。

圖4 不同質量濃度Cd2+對菌株M2菌落直徑的影響Fig 4 Influences of different mass concentrations of Cd2+ on the colony diameters of strain M2

圖5 不同質量濃度重金屬對菌株M2菌落直徑的影響Fig 5 Influences of different mass concentrations of heavy metal on the colony diameters of strain M2

3 討論

采用梯度濃度馴化的方法從校園內煤場土樣中分離得到抗鎘真菌M2,它在鎘濃度為2000 mg/L的液體培養基中生長良好,抗鎘性較強。根據形態學鑒定菌株M2為彎孢霉屬(CurvulariaBoedin)新月彎孢霉 (Curvularialunata)。通過18S rDNA序列分析鑒定菌株M2為旋孢腔菌屬(Cochliobolus)月狀旋孢腔菌(Cochlioboluslunatus)。彎孢霉屬的有性態是旋孢腔菌屬(Cochliobolus)、擬旋孢腔菌屬(Pseudocochliobolus)[9-10,12]。月狀旋孢腔菌為旋孢腔菌屬的模式種[13],新月彎孢霉即為月狀旋孢腔菌的無性態。因此,兩種鑒定方法結果一致。研究發現,菌株M2對多種重金屬有抗性,強弱順序為Cd2+> Pb2+> Zn2+> Cu2+> Ni2+> Co2+> Cr2+。

國內外報道的鎘抗性真菌種類主要有Metarhiziumanisopliae、Saccharomycescerevisiae、Fusariumoxysporum、Phomopsissp.[8]、Phanerochaetechrysosporium[14-15]、Paecilomyceslilacinus[16]、Gliocladiumviride、Mucorsp.和Aspergillusniger[17]。關于新月彎孢霉的研究,集中在產甾體化合物,產絮凝劑和產漆酶[18-19]等方面。新月彎孢霉對重金屬的抗性尤其是對鎘的抗性研究報道較少,馮宏等[20]從電子垃圾污染區土壤得到一株新月彎孢霉Cd7,其可在鎘質量濃度為2000 mg/L的PDA抗性平板上生長,菌株Cd7對9種重金屬離子抗性的強弱順序依次為:Zn2+、Cd2+(>2000 mg/L)>Pb2+(1500 mg/L)>Cu2+(500 m/L) >Co2+(100 m/L)> Ni2+、Cr2+(50 mg/L)>Hg2+、Ag+(25 mg/L)。M2和Cd7對鉛、銅、鈷、鎳和鉻的抗性差別不大,但對鎘和鋅的抗性上有較大區別。菌株M2可在鎘質量濃度為4000 mg/L的平板上生長,比Cd7的鎘抗性強。而Cd7可在鋅質量濃度為2000 mg/L的平板生長,比M2的鋅抗性強。這可能是由于兩個菌株分離來源不同,生存環境有差異,對重金屬的抗性有所不同。

從煤場區土壤中分離得到菌株M2,能夠在煤礦環境中生存,并對各種重金屬有一定的抗性。今后可進一步對其抗重金屬機制進行探討,為生物法修復煤礦重金屬污染提供有力的理論支持。

[1]楊永豐.正確看待當前煤炭形勢加快煤炭行業結構調整[J].內蒙古煤炭經濟, 2014(3):2-3.

[2]李東艷, 龐少鵬, 徐心遠, 等.煤矸石山周圍農田土壤重金屬形態分布及風險評價[J].河南理工大學學報(自然科學版), 2015, 34(5): 722-729.

[3]王興明, 董眾兵, 劉桂建, 等.Zn, Pb, Cd, Cu在淮南新莊孜煤礦矸石山附近土壤和作物中分布特征 [J].中國科學技術大學學報, 2012, 42(1): 17-23.

[4]郭二果, 張樹禮, 蔡 煜, 等.草原區露天煤礦開發對土壤環境質量的影響[J].露天采礦技術, 2012 (1): 93-97.

[5]馬從安, 王啟瑞, 才慶祥.大型露天煤礦重金屬污染評價[J].礦業安全與環保, 2007, 34(2): 36-37.

[6]劉志彥, 田耀武, 陳桂珠.礦區周圍稻米重金屬積累及健康風險分析[J].生態與農村環境學報, 2010, 26 (1): 35-40.

[7]滕 應, 駱永明, 李振高.污染土壤的微生物修復原理與技術進展[J].土壤, 2007, 39(4): 497-502.

[8]丁自立, 吳金平, 游艾青, 等.耐鎘耐鉻絲狀真菌菌株的篩選與鑒定[J].中國農學通報, 2016, 32(27): 105-108.

[9]魏景超.真菌鑒定手冊[M].上海:上??茖W技術出版社,1979.

[10]陸家云.植物病原真菌學[M].北京:中國農業出版社, 2000.

[11]何毅婷, 楊汝德, 張 廣, 等.以18S rDNA 序列鑒定一株產纖維素酶真菌[J].現代食品科技, 2008, 24 (7): 638-640.

[12]SAMUELS G J, SIVANESAN A.Graminicolous species ofBipolaris,Curualaria,Drechslera,Exserohiilumand their teleomorphs[J].Mycologia, 1989, 81(1):170-171.

[13]NELSON R R, HAASIS F A.The perfect stage ofCurvularialunata[J].Mycologia, 1964, 5(2): 316-317.

[14]陳翠雪, 李清彪, 鄧 旭, 等.黃孢展齒革菌菌絲球同時吸附鉛鎘離子的動力學[J].離子交換與吸附, 2003, 19(2): 133-138.

[15]PAKSHIRAJAN K, SWAMINATHAN T.Biosorption of lead, copper, and cadmium byPhanerochaetechrysosporiumin ternary metal mixtures: statistical analysis of individual and interaction effects [J].Applied Biochemistry Biotechnology, 2009, 158(2): 457-469.

[16]ZENG X X, CHAI L Y, TANG J X, et al.Taxonomy characterization and cadmium biosorption of fungus strain [J].Transactions of Nonferrous Metals Society of China, 2013, 23(9): 2759-2765.

[17]ARIFA T, HUMAIRA I.Development of a fungal consortium for the biosorption of cadmium from paddy rice field water in a bioreactor [J].Annals of Microbiology, 2012, 62(3): 1243-1246.

[18]鄭 楠, 趙 敏.真菌新月彎孢霉的研究進展[J].黑龍江醫藥, 2010, 23(2): 165-167.

[19]姜慶宏, 崔岱宗, 趙 敏, 等.一株產漆酶真菌新月彎孢霉JQH-100在染料脫色中的應用[J].菌物學報, 2010, 29(5): 678-682.

[20]馮 宏, 李永濤, 張 干, 等.強抗鎘真菌的分離鑒定及溶磷能力研究[J].華南農業大學學報, 2013, 34(2): 177-181.

猜你喜歡
孢霉抗性菌落
TTC應用于固體食品菌落總數測定研究
被孢霉對土壤養分有效性和秸稈降解的影響*
不同emm基因型化膿性鏈球菌的菌落形態
一個控制超強電離輻射抗性開關基因的研究進展
食用菌工廠化生產防治鏈孢霉技術探究
甲基對硫磷抗性菌的篩選及特性研究
桃色頂孢霉代謝產物對綠豆白粉病的防治作用
食品微生物檢驗中菌落總數測定的注意事項
甜玉米常見病害的抗性鑒定及防治
食用菌鏈孢霉發生與防治
91香蕉高清国产线观看免费-97夜夜澡人人爽人人喊a-99久久久无码国产精品9-国产亚洲日韩欧美综合