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耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌對抗菌藥物的耐藥研究

2022-02-17 09:58李翔張利芳
中國藥業 2022年3期
關鍵詞:外排烯類青霉

李翔,張利芳

(江蘇省蘇州市第九人民醫院,江蘇 蘇州 215200)

肺炎克雷伯菌(KP)是常見于人體呼吸道、消化道的革蘭陰性桿菌,也是醫院或社區獲得性感染的常見病原體[1?2]。碳青霉烯類抗菌藥物為治療KP的有效藥物,但臨床的不合理應用使耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(CRKP)的檢出率逐年遞增[3]。本研究中探討了CRKP的耐藥方式,以提高碳青霉烯類抗菌藥物的臨床合理用藥水平?,F報道如下。

1 資料與方法

1.1 儀器與試藥

儀器:VITEK2?Compact型全自動微生物分析儀(法國生物梅里埃公司),配有藥物敏感性(簡稱藥敏)試驗卡片;抗菌藥物紙片(英國Oxoid公司);ABI7500型基因擴增儀(美國ABI公司);HYDRASYS型蛋白電泳分析儀,C?880V型CO2孵箱,均購自美國Sebia公司;HC?2062型高速冷凍離心機(安徽中科中佳科學儀器有限公司);HulaMixer?Sample Mixe型渦旋混勻器(美國賽默飛世爾科技有限公司)。

試藥:外排泵抑制劑PAβN(美國Sigma公司,批號為0001429016);瓊脂糖(批號為D31018),引物(批號為B01019),均購自生工生物工程(上海)股份有限公司;Mueller?Hinton瓊脂(MHA)藥敏試驗培養基(青島日水生物技術有限公司,批號為071123);標志物DL 2000(批號為A1901B),Ex Taq DNA聚合酶鏈式反應(PCR)試劑盒(批號為191148),均購自北京基尼亞生物技術有限公司;細菌蛋白抽提液(美國賽默飛世爾科技有限公司,批號為2191785);肺炎克雷伯菌ATCC BAA1706(批號為491227),大腸埃希菌ATCC 25922(批號為561229),銅綠假單胞菌ATCC 27853(批號為550106),均購自上海北諾生物科技有限公司;注射用美羅培南(日本住友商事株式會社,批號為201701023);注射用亞胺培南(默沙東<中國>有限公司,批號為S012103)。

1.2 菌株來源

選取我院2017年1月至2020年12月收治的非重復性CRKP感染患者的耐藥菌株97株,分別編號為1?97號,均經VITEK2?Compact型全自動微生物分析儀分析確定對碳青霉烯類抗菌藥物耐藥。

1.3 藥敏試驗與細菌測定

采用VITEK2?Compact型全自動微生物分析儀對細菌進行鑒定和分類,并對抗菌藥物的敏感性進行初始檢測,操作步驟按儀器說明書進行。部分抗菌藥物無藥敏試驗卡片,參考美國臨床和實驗室標準協會(CLSI)發布的《抗菌藥物敏感試驗執行標準第27版信息增刊》(簡稱《標準》)中Kirby?Bauer(K?B)法進行補充試驗,質控菌株為肺炎克雷伯菌ATCC BAA1706、大腸埃希菌ATCC 25922與銅綠假單胞菌ATCC 27853[4]。

1.4 外排泵抑制試驗

參考《標準》中瓊脂稀釋法測定分離菌的最低抑菌濃度(MIC),分別測定添加及未添加外排泵抑制劑PAβN(終質量濃度為20 mg/L)的美羅培南和亞胺培南的MIC,兩者的測定質量濃度均為0.06~128.00 mg/L,每個質量濃度均接種10 000 cfu細菌。與未添加外排泵抑制劑PAβN相比,添加后的MIC提高4倍以上,即為細菌有外排泵機制[5]。

1.5 碳青霉烯酶篩選試驗

改良Hodge試驗:參考《標準》,將0.5麥氏濁度的致瀉性大腸埃希菌ATCC 25922用無菌生理鹽水稀釋10倍,均勻涂抹于瓊脂平板上,于中間位置貼放10 μg厄他培南紙片,接種環從紙片邊緣至平板外緣劃線接種待檢菌株,置35℃環境過夜培養。若次日厄他培南抑菌圈長出矢狀生長物,則視為待檢菌產碳青霉烯酶。

Carba NP試驗:取0.5%酚紅溶液2 mL,純水16.6 mL,10 mmol/L硫酸鋅溶液180 mL,置25~50 mL燒杯中,用10%鹽酸溶液或0.1 mol/L氫氧化鈉溶液調pH至7.7~7.9,作為A液;在A液中加入質量濃度為6 mg/mL的亞胺培南溶液(無菌注射用水配制),作為B液。取2支微量離心管,分別標記為a管和b管,均加入100μL細菌蛋白抽提液與1μL過夜培養的瓊脂平板接種環待測物,渦旋振蕩5 s,在a管中加入100μL A液,在b管中加入100 μL B液,渦旋,混勻,置35℃CO2孵箱中孵育2 h,每30 min查看并記錄顏色變化[6?7]。

1.6 PCR擴增和序列分析

采用煮沸法提取與純化細菌基因組DNA,以此為模板,采用PCR法擴增碳青霉烯酶[肺炎克雷伯菌產碳青霉烯酶(KPC)、AmpCβ?內酰胺酶(AmpC)類、新德里金屬β?內酰胺酶1(NDM?1)、超廣譜β?內酰胺酶(ESBLs)類]基因,即分別為blaKPC、blaAmpC類和blaNDM?1、blaESBls類。以1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測產物,經凝膠成像系統分析,由生工生物工程(上海)股份有限公司專業人員測定擴增產物的序列,并同GenBank數據庫中的序列進行比對,以確認擴增的產物為靶基因片段及基因型[8]。

1.7 腸道細菌基因組重復序列(ERIC)-PCR同源性分析

引 物 序 列:ERIC1為5′?ATGTAAGCTCCT?GGGGATTCAC?3′,ERIC2為5′?AAGTAAGTGACT?GGGGTGAGCG?3′。擴增條件:95℃下預變性7 min,94℃下變性1 min,45℃下退火1 min,65℃下延伸4 min,30個循環;65℃下延伸16 min,1個循環;將擴增的產物放入1.5%瓊脂糖凝膠中進行電泳,電泳條件為電壓100 V,時間100 min,Tris硼酸電泳緩沖液(20倍稀釋)[9]。

2 結果

2.1 藥敏試驗

共分離出97株CRKP,且對碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥率均為100.00%;對氨基苷類、頭孢類、喹諾酮類抗菌藥物的耐藥率均超過85.00%;對四環素類抗菌藥物的耐藥率均低于25.00%。詳見圖1。

圖1 97株CRKP對臨床常用抗菌藥物的耐藥率Fig.1 Drug resistance rate of 97 CRKP strains to commonly used antibiotics in the clinic

2.2 碳青霉烯酶篩選試驗

93株CRKP的改良Hodge試驗和CarbaNP試驗結果均為陽性,陽性檢出率為95.88%;4株(編號分別為24,31,68,72號)CRKP的CarbaNP試驗結果為陽性,而改良的Hodge試驗結果為陰性;3株(編號分別為6,13,93號)CRKP的改良Hodge試驗及CarbaNP試驗結果均為陰性。

2.3 耐藥基因檢測結果

97株CRKP中,blaKPC的檢出率為89.69%(89/97),且均為blaKPC?2型酶;blaNDM?1的檢出率為71.13%(69/97)。blaESBLs類耐藥基因中,blaSHV,bla?TEM,blaCTX?M的檢出率分別為96.00%,77.00%,61.00%;blaAmpC類耐 藥基因中,blaDHA,blaFOX,blaCTT的檢出率分別為100.00%,87.00%,61.00%;未檢出blaAAC,blaEBC,blaGES,blaMOX,blaOXA?48,blaSME,blaVEB,blaVIM。blaKPC,blaNDM?1,blaTEM在CRKP耐藥基因中更具代表性[10],其PCR擴增產物電泳圖見圖2。

M.Maker 1,4,7.陽性菌珠2,5,8.陰性對照3,6,9.陽性對照圖2 CRKP部分耐藥基因PCR擴增產物電泳結果M.Maker 1,4,7.Positive strains 2,5,8.Negative control 3,6,9 Positive controlFig.2 Electrophoretogram of PCR amplification products of partial drug resistance genes of CRKP

2.4 外排泵抑制試驗

9株CRKP(編號分別為3,18,25,30,39,58,75,86,94號)有細菌外排泵機制,提示主動外排泵參與了部分KP對碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥機制,9株菌株耐藥基因的檢出率均大于85%。

2.5 ERIC-PCR基因分型

共發現9種類型的CRKP,參考文獻[11?12],判斷各菌株的基因分型,其中1型42株,4型15株,5型14株,6型、8型各6株,2型、7型各4株,3型、9型各3株。部分耐藥菌株的ERIC?PCR基因分型見圖3。

3 討論

碳青霉烯類抗菌藥物在體內外均對革蘭陰性桿菌有抑制作用,是臨床治療KP的首選藥物,但隨著應用的增多,KP屬細菌對其耐藥的比例越來越高,部分治療多重耐藥KP感染有效的藥物(如亞胺培南、美羅培南等)已陸續出現耐藥現象,且呈不斷上升趨勢[7]。

本研究中從非重復性CRKP感染患者體內分離出97株CRKP,其在對碳青霉烯類抗菌藥物耐藥的同時,對氨基苷類等其他抗菌藥物亦有不同程度的耐藥。雖對四環素類抗菌藥物耐藥率較低,但該類抗菌藥物毒副作用較大,長期應用可對患者的消化、泌尿、血液、中樞神經等系統造成嚴重損害,并非為針對CRKP感染患者的首選藥物[13]??梢?,CRKP作為一種高耐藥、高毒力的多重耐藥菌,其有效抗菌藥物的選擇范圍較窄。

CRKP最主要的耐藥機制為產生碳青霉烯酶[14],水解青霉素類、頭孢類、碳青霉烯類等抗菌藥物。碳青霉烯酶在國內以KPC常見,也有耐亞胺培南(IPM)等。本研究中發現,CRKP感染患者存在多重耐藥基因積聚共存及外排泵抑制現象,與文獻[15?16]中提出的高產碳青霉烯酶(以KPC?2型酶為主),產AmpC酶伴外膜孔蛋白缺失或表達下調,主動外排泵系統異?;钴S等導致革蘭陰性菌對碳青霉烯類抗菌藥物耐藥的論點類似。

M.Maker 1,7.1型2,3,6,9,10,12.2型4,5.3型8.4型11.5型圖3 CRKP部分耐藥菌株ERIC-PCR基因分型電泳結果M.Maker 1,7.Type 1 2,3,6,9,10,12.Type 2 4,5.Type 3 8.Type 4 11.Type 5Fig.3 Electrophoretogram of genotypes of ERIC-PCR of partial drug resistance strains of CRKP

本研究中采用改良的Hodge試驗與CarbaNP試驗檢測碳青霉烯酶表型,結果KPC?2型酶為CRKP產碳青霉烯酶的最主要亞型,這可能是導致CRKP對碳青霉烯類抗菌藥物耐藥的主要機制。KPC?2型酶具有單獨致碳青霉烯類抗菌藥物耐藥形成,而不依賴于外膜孔蛋白缺失的作用,加之其基因位于質粒轉座子上,經可轉移的70 kb質粒編碼,傳播高效[17]。ERIC?PCR同源性分析發現9種CRKP,其中1型為主要流行菌株,提示1型克隆株可能更易在本院流行傳播,醫務人員在嚴格規范使用抗菌藥物的基礎上,還應加大醫院感染防控力度。

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