斑玉蕈種質資源評價及遺傳多樣性分析*

王 紅，劉俊杰，溫 浩，張 鵬，曹 君，肖 軍**，黃竹青

（1.遼寧省農業科學院，遼寧 沈陽 110161；2.遼寧省農業發展服務中心，遼寧 沈陽 110161；3.沈陽恒生生物科技發展有限公司，遼寧 沈陽 110161）

斑玉蕈（Hypsizygus marmoreus），又名真姬菇、玉蕈等，隸屬于擔子菌亞門（Basidiomycotina） 層菌綱（Hymenomycetes） 傘菌目（Agaricales） 離褶傘科（Lyophyllaceae） 玉蕈屬（Hypsizigus）[1]。斑玉蕈是一種低脂、高蛋白、味道鮮美的食用菌，深受廣大消費者的青睞，在日本有“香在松茸，味在玉蕈”之說[2-3]。隨著消費市場的不斷擴大，斑玉蕈已成為僅次于金針菇（Flammulina velutipes）、杏鮑菇（Pleurotus eryngii） 的第三大工廠化品種[4-5]。其商品根據子實體顏色的不同，可分為褐色品系和白色品系，褐色品系商品名為“蟹味菇”，菌蓋表面成褐色并伴有大理石狀斑紋；白色品系根據菌柄長短的不同，商品名分為“白玉菇”和“海鮮菇”2 個類別，其形態差異主要是由于培養時CO2濃度不同導致[6]。

種質資源又稱為遺傳資源，是選育優良菌種的基礎材料。種質資源的收集、評價、保藏是遺傳育種研究及培育新品種的基礎，對食用菌生產和科研工作有重大意義。目前，斑玉蕈種質資源評價主要采用體細胞不親和性（拮抗反應）、分子標記、形態學特征等方法。張宏美[7]運用不同的分子標記方法對斑玉蕈種質資源進行了評價，并開展了雜交育種研究。邱成書等[8]采用ITS（internal transcribed spacer, ITS）、ISSR（inter-simple sequence repeat, ISSR）、SRAP （sequence-related amplified polymorphism,SRAP） 等方法對斑玉蕈遺傳多樣性進行了評價，建立了評價體系。梁錫燊[9]采用ISSR，RAPD 和SRAP分子標記法對斑玉蕈雜交菌株進行遺傳多樣性分析。

目前，斑玉蕈品種多從國外引進[10]，斑玉蕈栽培企業存在菌種“卡脖子”現象，而部分菌株生產企業將獲得的斑玉蕈菌株又重新命名，造成市場所銷售的斑玉蕈菌株命名混亂，給其種質資源的研究造成了一定困擾。因此，通過采用拮抗反應、ITS、ISSR 評價方法，將所收集的斑玉蕈種質資源從體細胞親和性和分子標記角度進行分析，旨在確定斑玉蕈種質資源的親緣關系，從中尋找子實體形態、栽培適應性等方面的關聯信息，進而為斑玉蕈菌株新品種選育奠定種質資源的理論基礎。

1 材料與方法

1.1 供試菌株

于2020 年至2022 年收集供試菌株，共獲得國內主要栽培的斑玉蕈菌株67 株，編號及來源見表1。

表1 供試斑玉蕈菌株Tab.1 Test strains of Hypsizygus marmoreus

如表1 所示，若斑玉蕈菌株收集形式為子實體，需要在PDA 培養基上進行組織分離獲得菌絲，與試管種一起活化?；罨瘯r將67 株斑玉蕈菌絲塊分別轉接至PDA 培養皿中，每個菌株轉接5 皿，23 ℃倒置培養12～15 d。當菌絲長到距培養皿邊緣0.5 cm 時，從中選取1 個生長速度適中的培養皿，進行第2 次轉接，待菌絲長滿即完成活化。所有菌株均保存于遼寧省食用菌種質資源庫。

1.2 試驗儀器與試劑

PDA 培養基，英國OXOID 公司；真菌菌絲DNA 提取試劑盒，安諾倫北京生物科技有限公司；瓊脂糖，西班牙Biowest 公司；PCR 反應相關試劑，天根生化科技有限公司。

SPX-250B-Z 恒溫培養箱，上海博迅醫療生物儀器股份有限公司；30K30 離心機，德國Sigma 公司；TC-EA 型PCR 儀，杭州博日科技有限公司；JY-TD331A 凝膠電泳儀，北京君意東方電泳設備有限公司。

1.3 試驗方法

1.3.1 拮抗反應試驗

將活化后的67 株斑玉蕈菌株，用直徑為5 mm的打孔器在菌落邊緣打孔，取菌塊放入直徑為9 cm的培養皿內對峙培養，按照農業行業標準《食用菌菌種區別性鑒定拮抗反應》（NY/T 1845-2010）[11]進行試驗操作，記錄菌株間的拮抗線形態。

1.3.2 DNA 提取

將收集到的斑玉蕈菌絲放入1.5 mL 離心管中，采用真菌菌絲提取試劑盒提取菌絲體總DNA，用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測，分裝后于-20 ℃保存備用。

1.3.3 ITS 序列擴增

ITS 序列擴增引物為ITS1（5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′） 和ITS4（5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′）[12]。反應體系為2×Easy Taq Mix 10 μL，引物（10 μmol·L-1） 各1 μL，DNA 模板0.8 μL，ddH2O 補至20 μL。擴增反應程序為95 ℃預變性4 min；95 ℃變性30 s，57 ℃退火30 s，72 ℃延伸60 s，30 個循環；72 ℃延伸7 min[13]。PCR 產物用1.0 %瓊脂糖凝膠電泳檢測，后送至北京六合華大基因科技有限公司測序。

1.3.4 ISSR 序列分析

查閱相關文獻[8-9]，隨機選取3 個樣本，將文獻中報道的與斑玉蕈相關的ISSR 引物進行初篩，從中選用了11 條條帶豐度較高的ISSR 引物，用于多肽片段的擴增，見表2。

表2 ISSR-PCR 引物序列Tab.2 The primer sequence of ISSR-PCR

采用表2 引物，PCR 反應體系為1× Easy Taq Mix 7.5 μL，引物（10 μmol·L-1） 0.6 μL，ddH2O 補至15 μL。擴增反應程序為94 ℃預變性5 min；94 ℃變性45 s，53 ℃退火45 s，72 ℃延伸60 s，38 個循環；72 ℃延伸10 min。PCR 產物用2.0%瓊脂糖凝膠，80 V 電壓下電泳90 min 后用凝膠成像儀記錄[13]。

1.3.5 數據分析

1） ITS 序列對比分析。將測序序列經MEGA 7.0 軟件多序列比對后，與NCBI 數據庫比對，以荷葉離褶傘（Lyophyllum decastes） 為外類群，構建基因ITS-PCR 序列的系統進化樹。計算67 株斑玉蕈菌株的種間遺傳距離。

2） ISSR 序列對比分析。統計67 株斑玉蕈菌株間的多態性條帶數據，并用0 或1 記錄。采用NTSYS pc 2.1 軟件，按UPGMA 方法進行聚類分析，構建ISSR 聚類分析圖。

采用PopGene 32 軟件分析67 株斑玉蕈菌株種間遺傳距離和相似系數，并分析等位基因（Na）、有效等位基因數（Ne）、Nei's 基因多樣性指數（He）和Shannon 信息指數。

2 結果與分析

2.1 拮抗反應

67 株斑玉蕈菌株間拮抗反應明顯的有2 005 組，占90.68%；無拮抗反應的有206 組，占9.32%。根據有無拮抗反應將67 個樣品分為15 組，白色品系和褐色品系間均有拮抗反應，具體情況見表3 和圖1。

圖1 部分拮抗反應對峙圖Fig.1 Partial confrontation diagram of antagonism

表3 基于拮抗反應對菌株的分組Tab.3 The strain grouping based on antagonistic reaction results

由表3 和圖1 可知，第1 組11 個菌株、第4 組9 個菌株、第5 組13 個菌株、第9 組6 個菌株、第12 組2 個菌株為白色品系，菌株間無拮抗反應，與其他菌株間有明顯的拮抗反應，表明各組中菌株間親緣關系較近； 第2 組7 個菌株、第3 組6 個菌株、第6 組3 個菌株、第8 組2 個菌株、第10 組3個菌株為褐色品系，菌株間無拮抗反應，與其他菌株間有明顯的拮抗反應，表明各組中菌株間親緣關系較近。拮抗結果可將67 株斑玉蕈菌株分成15 個不同組，其中白色系菌株組8 個，褐色系菌株組7 個。

2.2 rDNA-ITS 序列對比分析

67 株供試菌株的rDNA-ITS 擴增條帶在800～900 bp，雙向測通后，將核酸序列在NCBI 數據庫中進行比對分析。結果表明，67 個菌株的ITS 序列與GeneBank 數據庫中斑玉蕈菌株的ITS 序列相似性達到99.5%以上，確定67 株供試菌株均為斑玉蕈菌株。

以荷葉離褶傘為外群，隨機選取NCBI 中的9 個斑玉蕈序列，與67 株斑玉蕈菌株ITS 序列構建NJ系統進化樹，見圖2。

圖2 基于67 個斑玉蕈菌株ITS 序列構建的系統發育樹Fig.2 Phylogenetic tree of 67 Hypsizygus marmoreus strains based on ITS sequences

由圖2 可知，使用MEGA 7.0 軟件構建系統進化樹顯示，67 株斑玉蕈菌株可分為3 個類群。其中組號為2、4、6、7、9、10、11、12、14 共9 個組34株菌株為類群I，組號為3、5、8、13、15 共5 個組30 株菌株為類群II，第15 組1 個菌株為類群III。第1 組中有3 株菌株聚在類群I 中，8 個株菌株聚在類群II 中，其菌株分布于ITS 系統發育樹的中間區域。67 株斑玉蕈菌株種內遺傳距離在0～0.079 4，平均遺傳距離為0.005 5±0.001 6。

2.3 ISSR 序列分析

選用11 條具有多態性的ISSR 引物，擴增出51個條帶，擴增條帶的DNA 片段為300～1 500 bp，多態性比例達到90.20%，ISSR 聚類分析圖見圖3。

圖3 ISSR 聚類分析圖Fig.3 Cluster analysis plots of ISSR

由圖3 的UPGMA 聚類分析發現，斑玉蕈菌株間遺傳相似系數變化范圍為0.70～1.00，在相似水平為0.74 時，67 個菌株分為三大類群。當相似水平為0.81 時，將類群I 分為6 個亞類群，第i 組9 個菌株、第iv 組11 個菌株、第v 組17 個菌株分別聚在一起，子實體顏色為白色；第ii 組8 個菌株、第iii組7 個菌株聚在一起，子實體顏色為褐色；第vi 組5 個菌株聚在一起，子實體顏色以褐色為主。在類群II、類群III 中，子實體顏色均為褐色。

利用PopGene 32 軟件對67 株斑玉蕈菌株的ISSR 結果進行統計分析，遺傳分析結果表明，斑玉蕈種質的平均等位基因（Na） 為1.920 5±0.272 1，平均有效等位基因數（Ne） 為1.461 5±0.344 1，平均Nei's 基因多樣性指數（He） 為0.276 5±0.171 5，平均Shannon 信息指數（I） 為0.422 6±0.227 9。遺傳距離和相似系數分析結果表明，67 株斑玉蕈菌株間Nei's 遺傳距離為0.034 7～0.627 2，遺傳相似系數為0.500 0～1.000 0，表明67 株斑玉蕈菌株種質遺傳多樣性水平較高。

3 結論與討論

斑玉蕈的栽培起源于日本，1972 年日本寶酒造株式會社首次人工栽培成功[1]。20 世紀80 年代起，我國對斑玉蕈開始進行生物學特征及栽培條件研究，目前已成為僅次于金針菇、杏鮑菇的又一工廠化栽培菌種。隨著栽培產業的快速發展，斑玉蕈菌種生產中存在同名異物或同種異名的現象，一直均未得到有效的解決。因此，建立一套快速有效的菌種評價方法，對斑玉蕈菌種的鑒定十分必要。本研究對國內主要的斑玉蕈種質資源進行了拮抗試驗，結果表明，67 株斑玉蕈菌株可確定為15 個不同組，表明不同菌種生產及栽培企業存在使用相同菌種的情況。

3.1 拮抗反應在斑玉蕈菌株評價中的作用

微生物間的拮抗反應在自然界中普遍存在，為防止遺傳中不同個體間的融合，是一種種間排除異己的現象[14]。真菌間的拮抗反應主要表現為不同菌落相互接觸后，出現拮抗線。不同菌株拮抗線的顏色、寬度等特征差異較大，而相同菌種間無此現象[15-16]。試驗中不同斑玉蕈菌株進行拮抗反應時，符合真菌間拮抗反應的特性。斑玉蕈菌株間的拮抗反應屬于隆起型，相同菌株間的菌落交界處菌絲隆起，但從背面觀察，培養基中無帶狀色素沉淀產生；不同菌株間菌落交界處菌絲隆起，隨著隆起時間的延長，菌落交界處培養基中有帶狀色素沉淀產生，即拮抗線，且拮抗線顏色、寬窄不一，從拮抗線的形態也能反映出不同菌株間親緣關系的遠近，這與黑木耳（Auricularia heimuer）種間發生拮抗反應后拮抗線產生顏色的現象類似[17]。從菌株子實體顏色看，白色品系和褐色品系菌株間均會產生明顯的拮抗反應，與金針菇白色菌株和黃色菌株間產生明顯拮抗線的表現一致[18]。2個品系間不但有拮抗反應，而且營養成分含量也不同[19-20]，因此評價種質資源時同時關注對應的子實體顏色有一定的實際意義。

3.2 rDNA-ITS 序列對比分析在斑玉蕈菌株評價中的作用

ITS 序列是內轉錄間隔區（internally transcribed spacer，ITS），位于真菌18S、5.8S 和28S rRNA 基因之間，具有較高的保守性。ITS 的保守性表現為種內相對一致，種間差異明顯，因此被廣泛用于真菌不同種屬的鑒定、種內遺傳多樣性分析[21-22]。供試樣本ITS 序列對比后均被鑒定為斑玉蕈，67 株斑玉蕈菌株間親緣關系近，遺傳距離小，分化程度低，與林輝等[12]對19 株斑玉蕈進行ITS 聚類分析的結果相似。通過系統進化樹將67 株供試菌株分為3 個類群，從菌株的子實體顏色看，ITS 序列分析無法區分子實體顏色；從菌株來源看，從大型工廠化瓶栽斑玉蕈的子實體中分離得到的菌株，絕大部分聚在類群II，可推測聚類于類群II 的菌株更適合用于工廠化瓶栽出菇。

3.3 ISSR 序列分析在斑玉蕈菌株評價中的作用

ISSR 是一種簡單重復序列間的擴增多態性分子標記，可同時提供多位點信息，并揭示不同SSR 位點個體間的變異信息[23]。通過UPGMA 聚類分析發現，在相似水平為0.74 時，67 株斑玉蕈分為三大類群。當類群I 中的相似水平為0.81 時，分為6 個聚類群。這6 個聚類群和類群II、III 可將子實體的顏色基本區分開。只有類群I 中的第6 個聚類群中含有褐色子實體和白色子實體， Z10、Z28、Z32 和Z45 間無拮抗反應，子實體顏色為褐色；Z15 子實體顏色為白色。一般情況下，白色品系是褐色品系的白色突變種[24]，Z15 和Z10、Z28、Z32、Z45 聚為一類，表明5 個菌株間具有較多共同的遺傳背景[25]，Z15 有可能是Z10 的突變株，但還需通過轉錄單位間隔區2（IGS2）、隨機擴增多態性DNA（RAPD）等分子標記技術進一步驗證[26]。

3.4 不同評價方法的比較

斑玉蕈種質資源評價采用了拮抗反應、ITS 和ISSR 共3 種評價方法，3 種評價方法相輔相成，各有優缺點。拮抗反應操作簡單，通過菌株菌落交界處菌絲的形態，即可判斷出對峙菌株間有無拮抗反應，對于菌株種屬信息明確的菌株，采用這種判斷方法便捷可靠；但當菌株種屬信息不全時，還需有ITS 的輔助證明才能確定。ITS 評價方法可有效判斷菌株的種屬信息，還可以初步判斷菌株種間的遺傳距離，但精確度低于ISSR 分析。ISSR 分析精確度較高，但需要樣本量較大，如拮抗反應試驗的第1組中，組內菌株間無拮抗反應，但通過ISSR 分析發現部分菌株分布于不同的類群中；而與所有菌株都有拮抗反應的菌株（如Z15），由于樣本數量有限，缺乏與之無拮抗反應的菌株，因此ISSR 聚類的有效性需要其他的分子標記方法輔助驗證。

通過試驗評價了所收集到的斑玉蕈種質資源，3 種評價方法提供了多種有價值的信息，由于單一評價方法在理論上或實際應用中有其優勢和局限性，將3 種評價方法相結合可彌補單一評價方法可能存在的誤差。種質資源評價的實踐意義在于生產實踐，通過對斑玉蕈進行種質資源評價，得知適宜工廠化栽培的菌株主要分布于ITS 法聚類的第II 類群，ISSR 法聚類中第I 大類群中的i、ii 類群及第III 大類群，且ISSR 法可將子實體顏色進行區分。試驗以3 種評價方法得出的結論，可為斑玉蕈新品種選育、顏色遺傳規律研究提供初步遺傳背景信息。