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一個為高分辨質譜代謝組學數據提供快速預鑒別服務的微信公眾號

2015-01-16 10:44
質譜學報 2015年6期
關鍵詞:負離子四物湯代謝物

一個由軍事醫學科學院放射與輻射醫學研究所梁乾德博士開發的微信公眾號,目前公益性地提供基于四類數據庫(HMDB、SWTDB、SDRSDB/SDRUDB和HMUDB)的對小分子單個高分辨電噴霧離子化(ESI)質譜質荷比(m/z)數據進行快速匹配檢索(預鑒別)的服務。用戶將待鑒別的m/z數值冠以數據庫標識和離子模式標識,形成一個字符串,發送給公眾號,可立即獲得預鑒別結果(即:可能的化學結構)。匹配的m/z偏差門限為10 ppm(即:待鑒別m/z值與數據庫m/z值差值的絕對值除以數據庫m/z值小于等于10 ppm)。

該公眾號的HMDB數據庫是著名的“人類代謝組數據庫”(The Human Metabolome Database,網址是http:∥www.hmdb.ca/,縮寫是HMDB)的衍生數據庫。是將“人類代謝組數據庫”(第二版)中收錄的8000余種代謝物,計算出每種代謝物在ESI條件下的4種常見負離子和6種常見正離子的理論質荷比,從而形成的衍生數據庫,可用于代謝物的鑒別。

該公眾號的SWTDB數據庫,是“四物湯相關植物化學成分理論質荷比數據庫”(四物湯相關植物包括地黃屬、當歸屬、芍藥屬和藁本屬植物)。是對文獻報道的1000余個四物湯相關植物化學成分,計算出每種化合物在ESI條件下的4種常見負離子和6種常見正離子的理論質荷比,從而形成的數據庫,可用于相關植物成分的鑒別。

該公眾號的SDRSDB/SDRUDB數據庫,是“Sprague Dawley大鼠血清/尿液固有成分(實測m/z信號)數據庫”。HMUDB數據庫是“健康青年尿液固有成分(實測m/z信號)數據庫”,可用于生物樣品中內源性代謝物和外源性化學成分的辨別。

更詳細信息可閱讀公眾號歷史消息中的詳細說明,或與開發者聯系(Email: liangqiande@yeah.net)。

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