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基于光譜重建優化的無人機高光譜影像估算牧草生物量

2021-01-06 03:03康孝巖張愛武龐海洋
光譜學與光譜分析 2021年1期
關鍵詞:立方體參量牧草

康孝巖, 張愛武*, 龐海洋

1. 首都師范大學三維信息獲取與應用教育部重點實驗室,北京 100048 2. 首都師范大學空間信息技術教育部工程研究中心,北京 100048

引 言

草地植被地上生物量(above ground biomass, AGB)是天然和人工草地產出的重要指標之一,其可以有效反映草原植物群落的生長狀況、演替趨勢和載畜能力等。牧草AGB的監測是草地管理和科學放牧政策制定的基礎,長期以來,牧草AGB估算主要以樣方調查為主,該方法準確度高,但難以進行大范圍草場AGB的評估。隨著星載遙感技術的發展,大尺度牧場牧草AGB的估算成為可能,學者們就此開展了相關研究[1-2]。Wu和Fu基于MODIS影像的FPAR/LAI產品(500 m分辨率)對西藏高原北部地區的牧草AGB進行了有效估算[2]; 有研究利用北京一號BJ-1與Landsat多光譜影像(30 m分辨率)就草地AGB的預測開展了對比研究,驗證了BJ-1對大范圍草地AGB估算的適用性; Naidoo等利用Sentinel-2A/B多光譜影像(10 m分辨率)估算了南非東開普敦省阿馬索爾山脈草地AGB,且達到了與WorldView-3影像(1 m分辨率)相當的預測精度[2]。星載影像估算牧草AGB具有大范圍、高效率和低成本等優勢[3],然而,中低等的空間分辨率(10~500 m)和較長的重訪周期難以滿足精準牧業對牧草AGB實時精準預測的需求。

與衛星相比,無人機(unmanned aerial vehicle, UAV)具有操作簡便,重訪周期短和不受云層遮擋等顯著優勢,其載荷傳感器可以快速獲取高空間和光譜分辨率的影像,滿足精準農業研究和實踐的需求[4]。當前,UAV高光譜影像(UAV hyperspectral image, UAV-HSI)多被用于種植業[5]和林業[6]等領域,而在草業監測中的研究和應用相對較少[7]。一般而言,UAV-HSI擁有數十到上百個波段,輻射分辨率多為8~12 bit; 同時,為了滿足精準監測的需求,其空間分辨率可達厘米級。故而,UAV-HSI有著較大的數據量,巨大的空間復雜度使得UAV-HSI難以在線實時處理,在內業處理中仍需較高的計算機性能,這是UAV-HSI當前亟待解決的問題之一[8]。

鑒于以上問題,本研究利用搭載有成像光譜儀的六旋翼低空無人機,獲取天然草地青草期的UAV-HSI,提出一種基于光譜重建優化的UAV-HSI數據簡化方法,有效降低其數據量; 以牧草AGB反演為例,利用偏最小二乘法回歸(partial least squares regression, PLSR)方法,探討UAV-HSI重建光譜對牧草AGB的預測精度,來驗證UAV-HSI重建優化方法的有效性,以期為UAV-HSI更好地應用于草地監測提供一種新的可行性方案。

1 實驗部分

1.1 研究區域

研究區位于青海省海北藏族自治州海晏縣西海鎮東北部(37°00′22″N, 100°55′11″E) (圖1),總面積約為4 hm2。西海鎮地處祁連山環青海湖盆地,屬高原大陸性氣候,是中國溫性草原與高寒草甸草原的過渡地帶,海拔高度3 100~3 150 m。典型植被主要有蒿草、針茅草、芨芨草、賴草、黑柴胡和香青等[4]。

圖1 研究區Fig.1 Study area

1.2 高光譜影像數據獲取與處理

本研究使用自主研發與集成的無人機高光譜成像系統ASQ-Hyper192(推掃式成像系統)[4],于2018年7月31日11時—14時在研究區開展數據采集,天氣晴朗無風,光照強度穩定。無人機飛行高度為100 m,影像空間分辨率約為0.1 m; 光譜范圍為400~1 000 nm; 原始數據共有192個波段,去除噪聲嚴重波段后,剩余149個有效波段; 輻射分辨率為8 bit,定標后光譜影像以32 bit或64 bit浮點數記錄。

試驗場共布設了7個地面控制點,架設了一臺GPS基站,采用實時動態定位RTK方法精確測定每個控制點的經緯度及高程; 布設有4塊定標板,反射率分別為5%,20%,40%和60%。首先,根據利用POS (GPS/INS)數據對原始高光譜影像進行拼接和幾何粗校正; 然后利用地面控制點的精確三維坐標進行幾何精校正; 最后,利用經驗線性法對幾何校正后的影像進行輻射定標,得到樣區牧草冠層的反射率影像(圖1)。

1.3 牧草AGB數據的采集與處理

牧草采樣與UAV-HSI的采集同步開展,如圖1所示,共采集了30個有效樣本: 首先,采用50 cm×50 cm的樣方,利用RTK方法測量樣方中心點的經緯度; 然后,對樣方內的牧草齊地面刈割,裝袋密封。在實驗室對植物樣品進行清洗,然后放入烘箱中烘干至恒重,記錄; 換算為單位面積內的干重AGB(g·m-2)。

鑒于測區UAV-HSI的空間分辨率為10 cm,而樣方邊長為50 cm,故以樣方中心點坐標所對應的UAV-HSI上像素為中心,取5×5像素塊立方體作為該樣方牧草冠層的反射光譜圖像,并以其均值光譜作為樣方牧草冠層的反射光譜。

1.4 光譜重建與優化

樣區UAV-HSI立方體大小為1 724×3 536×149 (有效光譜數量為4.45×106),通常光譜由值域為(0, 1)的一組浮點型小數記錄。本研究光譜影像若以單精度浮點型記錄,則需3.38 GB的存儲空間; 以雙精度記錄,則需要6.77 GB??梢?,UAV-HSI有著較大的數據量級,不利于對其進行有效采集、存儲、傳輸和分析,也不利于推廣到更大范圍的研究區。

針對以上問題,提出一種基于特征參量化的光譜重建與優化方法,試圖到達如下兩個目標: ①大幅降低UAV-HSI立方體的數據量,即所需的存儲空間; ②重構光譜能夠達到與原始光譜相當的牧草AGB預測精度。

1.4.1 UAV-HSI立方體參量化存儲及初步重構

傳統的光譜特征參量化方法旨在簡化光譜結構以提高分類效率,簡化后的光譜損失了大量的光譜細節,且難以開展有效的光譜重構。本工作以往研究將圖片壓縮量化方法引入到光譜量化和分類領域,提出了光譜高階二值編碼方法,并驗證了該方法在地物光譜分類中的高性能。引入高階殘差量化的思路,本研究對UAV-HSI立方體進行參量化存儲和光譜的初構: ①光譜參量化與存儲: 對UAV-HSI的每條光譜進行M階(Order-M)參量化,可得到M個二值立方體(Hi)及對應的量化系數二維矩陣(βi),并以此替代原始光譜立方體進行光譜數據的存儲。②光譜初構: 基于M階參量化數據,進行光譜的初步重構。其流程如圖2所示。

圖2 光譜立方體參量化及其初步構建的簡明流程

圖2中,a0為實常數;M?N(波段數)。為獲得上述參量化的結果,需要對每條光譜進行相同的處理,其基本流程如下:

對一條具有N個波段的牧草冠層光譜S,將其每個波段反射率[∈(0, 1)]表示為編碼系數β1與碼字±1的點積,即S≈β1H1,其中β1>0,H1∈{1, -1}N, 通過最小化(S-β1H1)的l2范數[式(1)],可求解出與S最接近的近似光譜對應的β1和H1[式(2)]

(1)

(2)

式(1)和式(2)中,l1和l2分別表示向量的1-范數和2-范數。sign為符號函數,s(n)∈S,當s(n)≥0時,sign[s(n)]=1; 當s(n)<0時,sign[s(n)]=-1。

顯然,式(1)和式(2)的光譜近似β1H1具有較大的誤差(一階殘差)R1

R1(S)=S-β1H1

(3)

將R1(S)視為新的光譜矢量,亦可進行式(1)和式(2)的光譜近似,即可解算出β2和H2,并通過式3可得二階殘差R2(S)。如此,通過M次的±1編碼,可提取出M個{-1, +1}N的特征參量,即光譜矢量的每個元素被特征化為M個1 bit的碼字。

對UAV-HSI立方體而言,通過多階參量化處理,其最終可表示為M個二值立方體(Hi)及相應的參量化系數二維矩陣(βi),以此替代原始光譜立方體進行存儲,鑒于的Hi的存儲量遠高于βi,可認為該參量化存儲形式的等效比特數為M,可節省磁盤空間Δd

(4)

式(4)中,F為原始光譜的數據存儲類型的比特數,單精度下F=32,雙精度下F=64。當M=4時,Δd≈87.5%~93.8%,此時可降低1個數量級。

(5)

式(5)中,Hi和βi分別為第i階參量化光譜及其系數。隨機選擇一個樣方的冠層光譜[圖3(a)],進行參量化及初步重建,如圖3(b)—(h)所示。

圖3 牧草冠層光譜(a)與其1~7階初構光譜(b—h)的比較Fig.3 Comparison between the raw spectrum (a) and the preliminarily reconstructed spectra (order 1~7 (b—h)) for a spectrum

由圖3(a)—(h)可見,①M越大,初構光譜的細節越豐富,與原始光譜越接近; ②初構光譜的反射率取值范圍有限,經研究發現最多為2M個,如此,初構光譜具有明顯的“鋸齒”特征,尤其在前4階(M≤4)。有限的取值范圍和顯著的“鋸齒噪聲”可能會影響初構光譜在定量應用中的準確度和精度。

1.4.2 基于Savitzky-Golay濾波的光譜優化

鑒于初構光譜的上述缺點,研究嘗試運用Savitzky-Golay (SG)濾波[9]對初構光譜進行優化,試圖重建缺失的部分光譜細節。SG濾波常被用于光譜的去噪和平滑,與移動均值濾波、加權移動均值濾波和中值濾波相比,SG濾波簡單有效,光譜失真程度較小[10]。

(6)

式(6)中,x∈[-r,r],并定義擬合誤差函數

(7)

通過最小化擬合誤差E,即令E對各個系數的導數為0,見式(8)

(8)

由式(8)可求解出各擬合系數ak,然后解算出波段n對應的擬合值,替換原值s(n)。

本質上,SG光譜濾波屬于一種多項式卷積濾波,多項式的次數d(degree)越高,對濾波前的光譜保留的光譜細節越多; 而鄰域半徑r(radius)越大,平滑效果越好,對噪聲的衰減越大[9-10]。故而,對PRS進行SG濾波優化之前,需要設定適宜的參數d和r。

以圖3樣方光譜為例,首先分別計算了其1到4階的初構光譜PRS,并在d∈[1, 10],r∈[5, 30]下進行SG濾波,以獲取優化光譜OPRS (optimized PRS); 然后,解算各OPRS與原始光譜[圖3(a)]之間的相關系數SCC (spectral correlation coefficient)、光譜角SAM (spectral angle mapping)和光譜距離SVD (spectral vector distance),并與PRS作對比,如圖4所示。

圖4 初構光譜PRS和優化光譜OPRS的光譜保真性比較 紅色平面: PRS; 曲面: OPRSFig.4 Fidelity comparison between PRS and OPRS red planes: PRS; curved surfaces: OPRS

就評價指標而言,顯然,SCC越大,SAM和SVD越??; 則光譜保真性越高。結果顯示,① PRS和OPRS均有著較高的光譜保真度,總體而言,OPRS明顯優于PRS,驗證了SG濾波在初構光譜優化上的有效性。② OPRS在多數(d,r)上的光譜保真性均顯著優于PRS; 僅在部分線性擬合(d=1)上,前者劣于后者。③ 綜合1~4階OPRS來看,當d∈[2, 4],r∈[10, 25]時,OPRS有著最為穩定且高保真的性能。圖5展示的是d=3,r=25時OPRS與原始光譜Raw和初構光譜PRS的對照結果,從整體及局部細節上,可以明顯看出,OPRS與Raw的相似程度遠高于PRS。

此外,對實驗區UAV-HSI的其他樣方光譜及非樣方光譜開展了上述實驗,均表現出近似的結果,驗證了OPRS的高穩定和高保真性能。在下面的研究中,將以d=3,r=25作為SG濾波的最佳參數。

圖5 光譜比較(d=3, r=25)Fig.5 Spectral comparison (d=3, r=25)

1.5 牧草AGB估算模型訓練與測試

研究選用偏最小二乘回歸(partial least squares regression, PLSR)來訓練和測試反演模型,與植被指數法和特征波段選擇法等的回歸方法相比,PLSR能夠充分利用所有波段的信息,便于全面評估OPRS的優劣。

2 結果與討論

2.1 牧草AGB與光譜之間的相關性比較

首先,對牧草AGB與原始光譜、初建光譜、優化光譜等的各個波段之間的相關性大小進行了分析,見圖6(a)—(i),討論了兩種重建光譜在單波段上對牧草AGB估算的性能優劣,初步探討了重建光譜對牧草AGB估測的能力強弱。圖6表明,①原始光譜與牧草AGB的相關性在400~680 nm波段區間呈劇烈波動的弱相關,而在760~950 nm上呈現相對穩定的強相關[見圖6(a)]; ②初建光譜PRS整體上與原始光譜的情況類似,隨著階數的增加,兩者與AGB的相關性曲線越來越接近,但PRS的曲線變化更劇烈,如圖6(f)—(i)2~4階的低相關譜段; ③由于光譜取值范圍有限,OPRS和PRS的一階重建光譜均與AGB呈現極穩定的相關性趨勢,尤其在400~680和760~950 nm; ④相對而言,OPRS的表現最優,在低相關(400~680 nm)和高相關(760~950 nm)波段,其波動性均明顯小于原始光譜和初構光譜,并且其相關性均值略高于原始光譜和初構光譜。因此,從光譜與牧草AGB的相關性曲線對比,分析認為,OPRS具有相對較高且最為穩定的預測能力。

圖6 牧草AGB與光譜變量的相關系數(絕對值) (a): 原始光譜; (b—e): 1~4階PRS; (f—i): 1~4階OPRSFig.6 Absolute correlation coefficients [ABS(CC)] between grassland AGB and spectral variables (a): Raw spectra; (b—e): Order 1~4 PRS; (f—i): Order 1~4 OPRS

2.2 基于PLSR的牧草AGB預測與評估

圖7為各光譜對牧草AGB的PLSR預測值及與觀測值的對照結果。1∶1關系圖直觀地反映了原始光譜、PRS和OPRS對牧草AGB的估算性能,相對而言,2~4階的OPRS對AGB的預測效果[圖7(g—i)]明顯優于同階的PRS[圖7(c—e)],也明顯優于原始光譜[圖7(a)]。

在9種光譜中,4階和3階OPRS的預測精度分別達到最優和次優; 結合其參量化存儲特性,可知,在降低1個數量級的情況下,OPRS取得了優于原始光譜的牧草AGB預測性能,驗證了OPRS在兼顧數據簡化和AGB準確預測上的有效性。

圖7 牧草AGB的PLSR模型評價 (a): 原始光譜; (b—e): 1~4階PRS; (f—i): 1~4階OPRSFig.7 PLSR models evaluation of grassland AGB prediction (a): Raw spectra; (b—e): Order 1~4 PRS; (f—i): Order 1~4 OPRS

表1 不同光譜處理對牧草AGB (g·m-2)的估測性能評價

實驗結果表明OPRS能夠達到本研究的兩個目標,即大幅壓縮UAV-HSI的數據量和取得與原始光譜相當水平的牧草AGB反演精度。除了光譜噪聲外,原始光譜還受到土壤反射率的影響,因此,本研究認為,除了降噪和光譜保真性的提升等兩方面因素外,OPRS是否在削弱土壤信息影響方面發揮了作用,值得在以后研究中開展定量探究。

3 結 論

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